Doctorant ecotoxicologie microbienne des eaux souterraines

Description du poste

Métier

F01 Biologie - Ingénieur·e / Chercheur·e

Intitulé du poste

Doctorant Ecotoxicologie microbienne des eaux souterraines

Contrat

Thèse

Temps de travail

Temps complet

Durée du contrat

36 mois

Contexte

Rejoindre le Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM), c'est intégrer l'établissement public de référence dans les sciences de la Terre rassemblant 1 000 personnes expertes et passionnées, réparties dans 29 entités implantées en France métropolitaine et d'outre-Mer. L'activité du BRGM a pour objectif la connaissance géologique et la compréhension des phénomènes liés au sol et au sous-sol, avec un enjeu : répondre aux défis des changements environnementaux à travers des projets innovants, à enjeux sociétaux.

La qualité de l'eau souterraine repose principalement sur les services écosystémiques fournis par les aquifères. Parmi ceux-ci, l'épuration naturelle de l'eau est un service écosystémique fondamental, atténuant notamment l'augmentation des polluants issus des activités anthropiques. Les microorganismes représentent une part importante de la biomasse dans ces environnements et jouent un rôle fondamental dans ces processus d'auto-épuration. Leurs activités métaboliques sont prépondérantes dans de nombreux cycles biogéochimiques et dans les processus de dégradation de contaminants (inorganiques et organiques) d'origine anthropique.

Description de la mission

Malgré ce rôle clé, peu de connaissances sont disponibles sur la diversité et les fonctions microbiennes dans les eaux souterraines en France. Ces connaissances sont pourtant un prérequis essentiel pour acquérir une meilleure compréhension du fonctionnement des aquifères et de l'impact de la pollution, étape nécessaire à l'élaboration de nouveaux outils de surveillance, complémentaires de ceux déjà existants, pour améliorer la gestion des eaux souterraines.

Ce projet de thèse aura pour objectifs de :
i) caractériser la diversité et l'état fonctionnel des bactéries dans plusieurs contextes hydrogéochimiques, ii) évaluer les impacts de pressions anthropiques sur les cycles biogéochimiques majeurs des eaux souterraines et iii) construire une boite à outils permettant de croiser les différentes sources d'information afin de développer de nouveaux indicateurs de gestion. Pour atteindre ces objectifs, le travail de recherche s'appuiera sur des approches d'écotoxicologie microbienne (analyses microbiologiques, biologie moléculaire et expérimentation) et de géochimie en couplant des approches de terrain et de laboratoire. Financement d'un doctorant intégré dans le projet DEEPTHOUGHT (Evaluating nitrate transformation in aquifers using microbiological, molecular and isotopic tools for an enhanced management of key groundwater ecosystem services).

Acquisition de données de terrain et de laboratoire en microbiologie/géochimie, analyse et interprétation des données et valorisation de la recherche.

Profil

Date de début souhaitée : 01/10/2025
Type de contrat : Thésard
Formation : BAC + 5
Expérience : Débutant

Vous mobiliserez les compétences et qualités suivantes :
- Compétences en écologie et/ou écotoxicologie microbienne, en particuliers maitrise des approches d'analyse de diversité (séquençage).
- Compétences et traitement statistique des données (en particulier maitrise de R et/ou language Python).
- Des compétences en géochimie/hydrologie seront un plus.
- Aptitude de travail en autonomie, et à travailler en équipe.
- Capacité de communication et à rendre compte, excellentes compétences rédactionnels.
- Maîtrise de l'anglais (lu, écrit, parlé).

Spécificité du poste

Ce poste requière du travail en laboratoire et sur le terrain avec des déplacements de courte durée en France et à l'étranger selon les besoins du projet (Europe).

Dans un environnement favorable à l'équilibre vie professionnelle/vie privée, notamment grâce au télétravail, le BRGM se distingue par son climat de bienveillance et de convivialité.
Labellisé HRS4R en 2021, notre souhait est de vous accompagner tout au long de votre vie professionnelle au sein du BRGM. Nous mettons à votre disposition de nombreux dispositifs pour développer vos compétences et votre expertise, avec des possibilités d'évolutions et de mobilités géographiques.
Au BRGM, vous bénéficierez de plusieurs avantages tels qu'une rémunération basée sur 12 mois, des JRTT, un restaurant d'entreprise, des infrastructures sportives, des prestations vacances et loisirs, …

Le BRGM vous garantit une procédure de recrutement transparente. Pour postuler envoyez-nous votre candidature (CV actualisé et lettre de motivation) jusqu'au 19/08/2025.
Sachez que tous nos postes sont ouverts à tous, au BRGM, nous sommes attachés.ées à la diversité !
Nous étudierons votre dossier de recrutement dès la fin de diffusion prévue. Si votre candidature est retenue, nous vous contacterons pour des entretiens de recrutement pendant lesquels vous échangerez avec la direction recruteuse, la direction RH et une direction transverse.