Les interactions plante-pathogène sont des processus complexes qui impliquent d'importants changements moléculaires et physiologiques tant chez l'hôte que chez le pathogène. Un nombre croissant d'études met en évidence le rôle des mécanismes épigénétiques dans la défense des plantes contre les agents pathogènes. Nous avons récemment montré qu'un facteur de virulence bactérien peut induire des modifications globales de la méthylation de l'ADN, et des altérations similaires du méthylome des plantes ont été observées lors d'infections bactériennes. Cependant, l'absence de définition spatio-temporelle précise limite notre compréhension de l'ampleur et de la fonction de ces modifications de la chromatine pendant l'infection.
Dans le cadre du projet EPIPAT financé par l'ERC, nous recherchons un ingénieur (H/F) motivé, rigoureux et curieux pour développer des outils et méthodes innovants visant à étudier les changements nucléaires lors des infections bactériennes, en combinant des approches d'imagerie et des analyses omiques.
Activités
Le candidat (H/F) retenu travaillera sur les infections bactériennes chez Arabidopsis, en réalisant un large éventail d'analyses génétiques et moléculaires telles que la PCR, la qPCR, les croisements génétiques et l'évaluation des phénotypes. Il/elle mettra en oeuvre des techniques classiques de biologie moléculaire, notamment le clonage et l'extraction d'ARN et d'ADN, et mènera des expériences épigénomiques et transcriptomiques pour explorer comment les modifications de la chromatine influencent la défense des plantes.
La personne recrutée utilisera des techniques de microscopie classique et confocale sur tissus végétaux, avec un accent particulier sur le développement de méthodes d'imagerie spécifiquement adaptées à l'étude des plantes infectées. Le candidat (H/F) contribuera aussi à la mise au point de protocoles de FACS, à la génération de lignées transgéniques, et à l'intégration de données variées pour faire progresser les objectifs du projet. Il/elle analysera et interprétera de manière critique les résultats, les replacera dans le contexte de la littérature scientifique existante, et communiquera efficacement son travail à travers des rapports écrits et des présentations orales en anglais. La personne recrutée pourra également superviser et encadrer des étudiants impliqués dans des aspects connexes du projet.
Compétences
Nous recherchons un candidat (H/F) motivé et curieux, avec un réel esprit d'équipe, désireux d'apprendre et d'explorer de nouvelles approches. Le candidat (H/F) doit être capable d'analyser les résultats de manière critique mais constructive, faire preuve d'un bon sens de la résolution de problèmes et gérer leurs projets avec un haut degré d'autonomie. Le candidat (H/F) doit être titulaire d'un doctorat (ou éventuellement d'un master) en biologie végétale, biologie moléculaire, génétique ou dans un domaine connexe. Une expérience de la culture d'Arabidopsis, de la génétique et des techniques standards de biologie moléculaire est requise. Il/elle doit également posséder une expérience pratique des techniques d'imagerie, idéalement de microscopie confocale ; une expérience en FACS constituerait un atout supplémentaire. Une expérience préalable dans les domaines de l'épigénétique des plantes, des petits ARN ou de la reproduction des plantes sera appréciée mais n'est pas indispensable. D'excellentes compétences en communication et en rédaction scientifique en anglais sont essentielles, et il/elle doit être capable de présenter de manière autonome ses résultats à l'écrit comme à l'oral en anglais (niveau minimum B2).
Contexte de travail
La personne recrutée sera affectée au sein d'un environnement de recherche dynamique et stimulant à l'Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP) à Strasbourg, offrant un accès à des plateformes de pointe en imagerie, génomique et biologie moléculaire des plantes. Le poste s'inscrit dans le cadre d'un projet financé par l'ERC, offrant l'opportunité d'aborder des questions de pointe à l'interface de l'épigénétique et des interactions plante-pathogène. Le candidat (H/F) rejoindra l'équipe « Epigenetic Regulation and Sexual Reproduction in Plants » (www.jullienlab.com), une équipe internationale et collaborative, engagée tant dans l'excellence scientifique que dans le développement personnel. Il/elle bénéficiera d'un encadrement adapté, d'opportunités pour développer de nouvelles compétences techniques et analytiques, ainsi que d'un soutien pour renforcer son réseau scientifique et son dossier de publications.
Contraintes et risques
- Déplacements possibles
- Risques associés au travail dans un laboratoire de recherche (produits chimiques, agents biologiques, environnements thermiques, etc.)
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