Contexte du recrutement et définition de poste :
Annonceur : MNHN - CESCO
Durée : 7 semaines, stage conventionné
Localisation : Paris (75)
Formation : BAC+2 à BAC+5
Modalités :
Dates du stage : 7 semaines sur la période du lundi 12 octobre au vendredi 4 décembre 2026
Localisation : MNHN – Paris (Jardin des Plantes), RN Moëze-Oléron
Responsables : Maud Mennerat, doctorante CESCO/MNHN, Romain Lorrillière, ingénieur de recherche CRBPO/CNRS, Nadezda Khodorova, ingénieure de recherche IMPMC.
Structures d’accueil :
Le stage se déroulera au Muséum National d’Histoire Naturelle, au sein de l’UMR 7204 Centre d’écologie et des sciences de la conservation (CESCO), au sein de la plateforme CRBPO au 45 rue Buffon, 75005 Paris.
Le Centre de Recherche pour la Biologie des Populations d’Oiseaux, CRBPO, est une plateforme technique d’écologie aviaire, de portée nationale, fondée sur le principe de science participative. La plateforme a la charge d’autoriser, coordonner, animer, structurer, archiver, valoriser et promouvoir la valorisation des suivis d’oiseaux sauvages par capture et marquage à buts scientifiques en France (incluant les relevés biométriques, télémétriques ou de prélèvements biologiques simples associés).
Le CRBPO fait partie de l’Unité Mixte de Recherche 7204 CESCO « Centre d’Ecologie et des Sciences de la Conservation », et est rattachée à l’Unité d’Appui et de Recherche PatriNat « Centre d’expertise et de données sur le patrimoine naturel ». Les tutelles du CRBPO sont le Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN), le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), l’Office Français de la Biodiversité (OFB), ainsi que Sorbonne Université (SU) et l’Institut de Recherche pour le Développement (IRD).
Le stage se fait en collaboration avec l'Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), un institut multidisciplinaire spécialisé en physique, sciences de la Terre et biophysique-bioinformatique, situé au cœur de Paris, au sein de l'Université de la Sorbonne et du Muséum national d'Histoire Naturelle.
Ce stage s’inscrit dans le projet Delta-Migr financé par PatriNat, centre d’expertise et de données sur la nature, via des fonds de l’Office français de la biodiversité (OFB). PatriNat assure des missions d’expertise et de gestion des connaissances sur la biodiversité et la géodiversité.
Contexte :
La plupart des espèces d’oiseaux confrontées à des fluctuations saisonnières de disponibilité de leurs ressources alimentaires adoptent une stratégie de migration (Somveille, et al., 2015). On observe ainsi chaque automne en Europe plusieurs dizaines de millions d’oiseaux migrateurs en déplacements annuels vers leurs zones d’hivernage après s’être reproduit.
Le suivi des oiseaux par la capture et le marquage (nommé communément le baguage), coordonné par le CRBPO (Centre de Recherche sur la Biologie des Populations d’Oiseaux) joue un rôle clé dans la surveillance des populations d’oiseaux. Ainsi, des programmes de baguage standardisés dédiés aux suivis de la migration des petits oiseaux chanteurs (passereaux) communs ( et ) ont parmi leur finalité, par la création d’indicateurs de phénologie, l’objectivation du décalage de leurs dates de migration automnale mais également la documentation et l’estimation des variations interannuelles de ces dates à travers la France en réponse aux changements globaux.
Les données de recapture des oiseaux bagués permettent d’avoir une première estimation de la provenance des oiseaux observés en passage migratoire à travers la France hexagonale (Atlas de Migration EURING). Cependant, pour mieux comprendre les effets des changements globaux sur la démographie, il est essentiel préciser leurs aires de reproduction pour mieux estimer les contraintes environnementales lors de la reproduction.
L’analyse des rapports des isotopes stables* d’hydrogène (aussi appelée analyse isotopique, détermination des signatures isotopiques, ou caractérisation isotopique) la teneur en isotopes stables dans les plumes muées sur les aires de reproduction a pour vocation de mieux comprendre d’où viennent les oiseaux migrateurs (Jiguet, et al., 2019).
En effet, le deutérium** est présent dans l’environnement en proportions variables en fonction des régions, et cette proportion est observable dans les plumes prélevées en France pendant le passage migratoire car elles poussent sur les aires de reproduction. Cela est liée à la consommation d’eau par les oiseaux (soit directement, soit par leurs ressources alimentaires) : si les atomes d’hydrogène de l’eau de l’environnement présentent des variations de taux d’isotopes, les atomes d’hydrogène de la kératine synthétisée à partir des ressources du milieu où les plumes poussent vont porter cette signature isotopique de l’aire d’alimentation lors de la reproduction.
Ainsi, le projet Delta-Migr lancé en 2026 échantillonne et analyse la provenance de 4 espèces cibles de passereaux via analyse isotopique du deutérium des plumes d’adultes et jeunes sur les deux saisons de migrations postnuptiales*** à venir.
Missions et objectifs du stage :
L’objectif de ce stage est de participer à la première phase d’analyses en laboratoire de l’étude. Il s’agit de l’analyse en 2H (deutérium) par spectrométrie de masse à ration isotopique (IRMS en anglais) et le pyrocube (système de transformation de l’échantillon en gaz analytique et d’introduction en IRMS suite à la pyrolyse à très haute température).
Le stage consiste donc à participer en laboratoire d’analyse isotopique à la préparation et la mesure du taux d’isotope d’hydrogène (deutérium) contenu dans les plumes de passereaux au sein de l’Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie, UMR 7590 (4 semaines de laboratoire, Paris au sein de la plateforme SSMIM (spectrométrie de masse isotopique du Muséum)), et de préparer des supports de vulgarisation scientifique sur le projet à visée du réseau de baguage ou/et d’analyser les premiers résultats de mesures sur le logiciel R au Centre d’écologie et des sciences de la conservation (CESCO), UMR 7204 (2 à 3 semaines, Paris).
Si le ou la stagiaire souhaite s’impliquer dans la phase de terrain :
1 semaine de terrain baguage en migration post nuptiale + prélèvement des plumes à la Réserve Naturelle de Moëze-Oléron, Charente Maritime, protocole SEJOUR
Profil recherché :
Profil Bac +2 à Bac +5 (dont équivalent césure) en biologie, chimie, sciences de l’environnement, gestion des milieux naturels ou en écologie.
-Sens de l’organisation, minutie et rigueur expérimentale.
-Aptitude au travail en laboratoire.
-Des premières expériences d’analyses via outils types spectromètres de masse isotopique, analyseurs élémentaires, ou chromatographes en phase gazeuses ne sont pas obligatoires mais fortement valorisées.
-Bonne pratique d’Excel ou équivalent.
-Français couramment lu, parlé et écrit.
Candidature :
Ce dossier comprendra un curriculum vitae détaillé et une lettre de motivation.
Les entretiens se dérouleront ensuite par visioconférence ou téléphone.
Pour toute précision, les candidats sont invités à prendre contact avec l’équipe encadrante.
Mots clefs : ornithologie – chimie - expérience – laboratoire - migration – baguage – isotopes
Définitions :
Isotopes stables : atomes avec un nombre de neutrons différent des atomes fréquents partageant le même nombre de protons, qui sont non radioactifs (stables).
Deutérium : atome d’hydrogène avec un neutron en plus que la forme majoritaire d’hydrogène.
Postnuptial : après la reproduction des oiseaux, c’est-à-dire quand il s’agit de migration, celle qui a lieu des aires de reproduction vers les aires d’hivernage pendant la fin d’été et automne.
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