Chargé d'études scientifiques - appui scientifique sur la fonge de france (f/h)

Informations générales Organisme de rattachement Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHN) Référence 2026-2247318 Date de début de diffusion 12/05/2026 Date de parution 12/05/2026 Date de fin de diffusion 11/06/2026 Localisation Paris Intitulé long de l'offre Chargé d'études scientifiques - Appui scientifique sur la fonge de France (F/H) Date limite de candidature 09/05/2026 Employeur MNHN Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels Domaine / Métier Enseignement et Formation - *Chargée / Chargé des études doctorales* Statut du poste Vacant Intitulé du poste Chargé d'études scientifiques - Appui scientifique sur la fonge de France (F/H) Descriptif de l'employeur Le MNHN est l’organisme de référence en France pour la taxonomie et les collections de spécimens. Dans ce cadre, des liens sont établis entre les départements de systématique (UMR 7205 ISYEB), les collections du MNHN (DGD-C) et PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD) pour assurer l’enrichissement et le maintien à jour du référentiel taxonomique national TAXREF, la valorisation de la collection nationale, et l’interopérabilité des données aux niveaux national et international. Descriptif du service TAXREF constitue la référence taxonomique nationale pour les dispositifs réglementaires et la gestion des données relatives aux espèces dans le cadre des politiques publiques (SINP, SIB, etc. ; art. L411-1 du Code de l’environnement). Diffusé librement depuis plus de 20 ans, il a été téléchargé plus de 68 000 fois depuis sa version 3 et sert de socle à la majorité des outils naturalistes nationaux ainsi qu’aux échanges inter-plateformes. Avec environ 85 000 entrées correspondant à 32 000 taxons terminaux, le référentiel de la fonge de France, englobant l’ensemble des champignons, y compris les lichens, représente un enjeu majeur pour la communauté d’acteurs impliqués dans la connaissance et la conservation de la biodiversité. Les attentes associées à ce référentiel ne se limitent pas à la gestion des données d’occurrence des taxons, elles incluent également : (1) la structuration et la documentation des relations fonctionnelles entre les champignons et les autres organismes, telles que les interactions de symbiose ou de parasitisme avec les plantes ; ainsi que les enjeux sanitaires liés aux infections ou aux intoxications, et (2) l’ intégration des fonctions écosystémiques, comme la décomposition et le recyclage de la matière organique, le rôle dans la résistance et la résilience des forêts face aux changements globaux, ou encore la restauration et dépollution des sols. Dans ce contexte, les besoins sont importants pour alimenter, consolider et maintenir à jour le référenti Description du poste Les activités Le(la) candidat(e) assurera l’enrichissement et la consolidation du référentiel fonge de TAXREF en prenant en charge : (1) la mise à jour du référentiel par l’analyse des données taxonomiques bibliographiques et d’inventaires, et (2) la valorisation de l’herbier national. En lien avec le réseau national des mycologues, les missions incluent : Contribuer activement au réseau des mycologues liés au Fungarium du MNHN ainsi que les spécialistes français et internationaux (échanges, concertation et prise en compte des décisions pour le référentiel) Assurer la consolidation nationale de TAXREF-Fonge en recensant tous les noms s’appliquant aux taxons de France via les bases de données naturalistes (GBIF, iNaturalist) et les collections du Fungarium Détecter les incohérences taxonomiques : (1) au sein de la fonge métropolitaine au regard de la littérature scientifique récente, (2) à l’échelle nationale en comparaison avec les référentiels internationaux (Index Fungorum, Mycobank), et (3) en concertation avec les réseaux d’experts Corriger, fiabiliser et compléter les données nomenclaturales (noms, auteurs, dates), en s’appuyant sur les publications originales et les spécimens du Fungarium Contribuer au référentiel de séquences ADN pour la fonge de France via les bases de données internationales (GenBank) et les programmes de recherches en cours, en lien avec le développement du futur référentiel national des séquences génétiques. Centraliser les besoins de séquençage liés aux problématiques taxonomiques et à l’enrichissement du référentiel. Si le (la) candidat(e) souhaite, il y a la possibilité de contribuer à du typage moléculaire (barcoding) Mobiliser les référentiels nationaux et internationaux existants afin de renforcer la standardisation, la visibilité et l’interopérabilité des données associées aux collections mycologiques du MNHN (SONNERAT) Enrichissement et mise à jour de la base TAXREF via l’application TAXREF-web (ajouts et modifications des noms du référentiel) Valoriser les résultats au travers de publications scientifiques, notamment sous forme de data papers et pour tester des hypothèses écologiques Descriptif du profil recherché Être titulaire d’un diplôme de Master ou d’ingénieur (Bac 5) dans les domaines suivants : biologie, taxonomie, systématique, évolution, biodiversité, écologie, conservation, environnement Rigoureu(x)se, sens de l’organisation et autonomie Connaissances, idéalement dans les domaines suivants : Nomenclature et taxonomie, idéalement de la fonge Mycologie Maîtriser les outils informatiques dédiés à la gestion des référentiels (systèmes d’information et bases de données relationnelles) Bonne maîtrise du logiciel R permettant les analyses statistiques Un savoir-faire de biologie moléculaire serait apprécié, mais non nécessaire Excellente capacité à travailler en équipe et à interagir avec une diversité d’acteurs Aisance rédactionnelle, en particulier pour la rédaction de protocoles et d’articles scientifiques, associée à une forte capacité à communiquer et à valoriser son travail tant en interne qu’en externe Temps plein Oui Informations complémentaires Informations complémentaires Venez rejoindre un établissement chargé d’histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d’une grande variété de métiers et d’activités, le Muséum vous propose d’intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant. Type de contrat : Contrat de projet Durée : 3 ans (1 an et renouvelable 2 ans) Lieu : Paris 75005, Jardin des plantes Rémunération : en fonction du profil du candidat retenu et des grilles de rémunération de l’établissement Indice 400-700, débutant accepté Date de prise de fonction : au plus tard le 1er Septembre 2026 Avantages : Remboursement de 50% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable En fonction du cycle de travail, télétravail possible (1jour/semaine) Mutuelle d'établissement Un comité social et une association sportive et culturelle Accès illimité aux sites de l’établissement avec invités Localisation du poste Europe, France, Île-de-France, Paris (75) Géolocalisation du poste 57 Rue Cuvier 75005 Paris Lieu d'affectation (sans géolocalisation) Jardin des Plantes Date de vacance de l'emploi 01/09/2026