Le/la candidat(e) retenu(e) aura pour mission d’apporter un soutien pour l’analyse de données d’expression (tissus entiers et cellules uniques) et pour le design des expériences de génomiques dans le cadre d’un projet visant à comprendre comment est intégrée dans le temps l’information donnée par la concentration de l’auxine dans les cellule du méristème apical caulinaire.
Activités
- l’analyse bioinformatique (et statistique) des données (épi)génomiques issues de séquençage haut-débit
- le stockage et la visualisation des données génomiques
- l’utilisation d’outils computationnels préexistants, leur adaptation et éventuellement le développement de nouveaux outils bioinformatiques
- la mise en forme des analyses réalisées et des résultats obtenus ainsi que leur restitution didactique
- le conseil, la formation et le soutien bio-informatique auprès des biologistes de l'équipe
- la veille scientifique sur les méthodes du domaine
Compétences
Savoir-faire
- Maîtrise de langages de programmation (Python, R, …) et de scripts (Bash, …)
- Expérience significative dans l'analyse de données (épi)génomiques issues de séquençage haut-débit
- Connaissances de statistiques appliquées à la génomique
- Maîtrise de l'anglais scientifique et technique
- Capacités organisationnelles, autonomie, rigueur et adaptabilité
- Capacité d’interaction aussi bien avec des biologistes que des informaticiens
Savoirs-être
Capacité à travailler en équipe, inventivité et ouverture d’esprit, autonomie et méthode dans la mise en œuvre du savoir-faire
Contexte de travail
Le laboratoire RDP (Reproduction et Développement des Plantes) est une unité mixte de recherche multi-tutelles (CNRS, INRAE, ENS de Lyon, UCBL, et associée à l’INRIA) composée de 9 équipes de recherche (environ 120 personnes). Le laboratoire est situé sur le site Monod de l'ENS de Lyon et dispose de l’intégralité des moyens et infrastructure nécessaires aux missions du poste.
Le laboratoire RDP (Reproduction et Développement des Plantes) est une unité mixte de recherche multi-tutelles (CNRS, INRAE, ENS de Lyon, UCBL, et associée à l’INRIA) composée de 9 équipes de recherche (environ 120 personnes). Le laboratoire est situé sur le site Monod de l'ENS de Lyon et dispose de l’intégralité des moyens et infrastructure nécessaires aux missions du poste.
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