Ingénieur d'études en bioinformatique (h/f)

Ingénieur d'études en Bioinformatique (H/F), Lyon

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur d'études en Bioinformatique (H/F)
Référence : UMR5284-FABLEG-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 08
Date de publication : mercredi 11 juin 2025
Type de contrat : CDD en informatique
Durée du contrat : 16 mois
Date d'embauche prévue : 1 septembre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : À partir de 2491 € brut mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+3/4
Expérience souhaitée : Indifférent
Code BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données

L'Ingénieur d'études en bioinformatique travaillera en soutien d'un projet visant à évaluer les changements cellulaires dans la dystrophie musculaire de Duchenne. Il/elle traitera et analysera des données RNA-seq sur noyaux uniques, et établira des listes de gènes différentiellement exprimés entre cellules saines et dystrophiques.

Activités

* Définir, en interaction avec les biologistes, le plan d'analyse et l'interprétation des données
* Réaliser les projets d'analyses de données biologiques du laboratoire, en utilisant les outils actuels de bioinformatique
* Identifier, concevoir et développer des outils informatiques adaptés aux problématiques de l’équipe ou des collaborations

Compétences

* Expérience en analyses omiques ou multiomiques (Bulk RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, single cell/nuclei)
* Maîtrise des langages de bioinformatique pour la communication avec les biologistes/techniciens
* Connaissance des aspects basiques de la bioinformatique (contrôle-qualité, recherche d'informations dans fichiers de séquençage)
* Compétences en visualisation de l'information
* Connaissance des techniques de comptage de reads en sortie d'alignement
* Maîtrise d’un outil d’analyse différentielle (DESeq2, limma, edgeR)
* Maîtrise d’un outil d’alignement contre référence (STAR, Bowtie2, BWA)

Contexte de travail

Vous travaillerez au sein de l'unité MeLiS (Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS 5284, INSERM 1314) dans l'équipe de Marcelle-LeGrand, dans la faculté de Médecine et de pharmacie de Rockefeller. L'équipe s'intéresse aux mécanismes moléculaires dans divers compartiments cellulaires, notamment dans les cellules neuronales et musculaires, et étudie les processus biologiques et leurs altérations dans les maladies humaines.

Pour plus d’informations : https:///melis/fr/

En rejoignant le CNRS, vous bénéficierez de :

* Un environnement stimulant avec des personnels de la recherche
* 44 jours de congés / RTT par an
* Excellentes conditions de travail (horaires flexibles, télétravail)
* Remboursement partiel des titres de transport (75%) + forfait mobilité durable jusqu’à 300€/an
#J-18808-Ljbffr