Ingénieur - etudes - données en recherche clinique h/f

MétierIngénieur - Etudes - Données en recherche clinique
Type de contratCDD uniquement
Service d'affectationInovAND
Présentation du service
InovAND, centre d'excellence dans le domaine des troubles du neuro-développement réunit en Île-de-France
des équipes cliniques et scientifiques ainsi que les associations de familles et de patients, afin d'assurer un
meilleur continuum entre expertise diagnostique et thérapeutique, de développer la recherche appliquée en
santé et fondamentale, et de renforcer la formation universitaire sur les troubles du neuro-développement. Ce
centre, coordonné par le Pr Richard Delorme (Service de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent, hôpital
Robert-Debré, AP-HP), s'intègre plus globalement dans la dynamique de l'Institut Robert Debré du Cerveau de
l'Enfant.

Le centre d'excellence InoVAND regroupe plus d'une trentaine qu'équipes cliniques et
scientifiques, mais aussi des associations.
- Il est piloté par le service de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent composé d'1 Chef
de service, 12 PH, 2 CCA, 9 internes, ainsi que du personnel non médical (psychologues,
orthophonistes, IDE, Logisticien)
- L'objectif du centre InoVAND est de promouvoir la recherche, et la clinique pour offrir des
soins d'excellence en partenariat avec un réseau d'associations. Vos missions
L'ingénieur de recherche sera en charge de la collecte des données brutes multimodales :
imagerie par résonance magnétique (IRM), électroencéphalographie à haute résolution (EEGHR) et basse résolution (EEG-LR), puces ADN, données cliniques, dans le cadre de la recherche
sur les troubles du neuro-développement.
- Collecter ces données pour les unités du service de pédopsychiatrie sur l'espace de
stockage NAS mis en place au sein de l'hôpital, en améliorant les procédures de collectes
déjà en place avec les différents techniciens.
- Organisation de la base de données et mise à disposition des données uniformisées pour
analyses.
- Réalisation d'une interface utilisateur permettant d'accéder à l'ensemble des examens
réalisés par chaque sujet de manière centralisée, ainsi que d'un outil de recherche
(JavaScript, MongoDB)
- Poursuite du travail de prétraitement des données multimodales, notamment
d'anonymisation des données mis en place afin d'identifier chaque sujet par un master code
unique. Conservation sécurisée de la correspondance sur serveur interne.
- Suivi ponctuel des différents protocoles de recherche pour lesquels l'hôpital est centre
d'inclusion, acquisition des données, formatage et livraison au PI selon les exigences de
chaque projet.
principales
- S'assurer de la bonne collecte des données dans chaque service selon la méthode et le
logiciel spécifique
- Mettre en place et maintenir des bases de données anonymisées d'imagerie clinique et
automatiser le flux de données pour une visualisation et une utilisation optimale des
images IRM et des enregistrements EEG
Activités
associées
- Organiser/Participer à la maintenance et à l'évolution de l'environnement informatique du
laboratoire
- Participer activement à la valorisation scientifique des projets de recherche
- Participer à la vie de laboratoire

Profil recherché
Expertise avancée en gestion de données et programmation informatique (environnement
UNIX, Python, Matlab, shell scripting, JavaScript)
- Développement Web (Vue.js, MongoDB, HTML/CSS)
- Connaissances en IRM cérébrales et EEG
- Maîtrise de l'anglais souhaitable
Savoirfaire
- Savoir organiser une base de données
- Savoir manipuler des images IRM et des enregistrements EEG-HR et EEG-LR
- Savoir adapter et développer des pipelines de traitements et d'analyses de données en
vue de leur utilisation pour la population pédiatrique
- Savoir faire le lien vers des utilisateurs non-experts
- Savoir gérer les priorités et les contraintes
- Savoir interagir avec des personnes de multiples expertises (cliniciens, chercheurs,
informaticiens)
Aptitudes - Aptitudes organisationnelles
- Autonomie Dynamisme Rigueur
- Capacité à organiser/animer un groupe de support
- Pédagogie
- Capacité à rendre compte
- Bon relationnel
Spécificité
(s) /
Contrainte
s du poste
- Veiller à la gestion, cohérence et exhaustivité des banques de données IRM et EEG avec
les données cliniques recueillies sur un logiciel hébergé par le serveur de l'hôpital
- Faire le lien le cas échéant avec les techniciens et cliniciens impliqués dans le recueil des
données
- Réaliser des déplacements sur différents laboratoires en Ile de France (Institut Pasteur,
NeuroSpin CEA Saclay) de manière ponctuelle
- Respect de la confidentialité des informations
Expérienc
es
souhaitées
- Expérience confirmée en gestion de base de données, et/ou en développement et
évaluation d'outils de traitement et d'analyse d'images
- Expérience en imagerie biomédicale
Diplôme(s)
souhaité(s
- École d'ingénieur, Master 2 (Bac +5)
- Doctorat en physique / imagerie médicale / traitement d'images

Schéma horaireJour
Temps de travail7h30
Horaires de travailTravail de semaine en 7h30 par jour
TélétravailOui

Description de l'hôpitalSitué à Paris (19è arrondissement), c'est l'hôpital pédiatrique de référence du Nord-Est parisien. Ses équipes prennent en charge les enfants de 0 à 18 ans atteints de pathologues aiguës ou chroniques, médicales ou chirurgicales et prodigue des soins de haute technicité. Il dispose également d'une maternité de niveau 3.
Référence de l'offre2