Ingénieur-e en immunologie

À propos de nous

Nantes Université est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d’université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) ainsi que Centrale Nantes, l’école des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire et l’École Nationale Supérieure d’Architecture de Nantes.

Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l’excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations, dans tous les domaines de la connaissance.

Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d'études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon.


Mission

L’ingénieur-e d’étude recruté-e aura pour mission principale l’isolement et la caractérisation des sous-populations de cellules épithéliales thymiques médullaires (mTEC) à partir d’échantillons de thymus humains, dans le cadre de la constitution d’un atlas de RNA-seq total des mTEC. Il/elle participera également à la caractérisation de la lignée cellulaire mTEC 4D6 avec et sans expression d’AIRE, incluant la préparation de librairies pour le séquençage RNA-seq total et le ribo-seq.

Activités principales

· Isolement des cellules épithéliales thymiques médullaires (mTEC) à partir d’échantillons de thymus humains obtenus en chirurgie cardiaque. Mise en œuvre de la stratégie d’isolement par digestion mécanique et enzymatique, sélection par billes magnétiques (CD45- EpCAM+) et tri cellulaire FACS (CD205- HLA-DR+). Isolement des sous-populations mTEC high (AIRE+ MHC-II high) et mTEC low à partir d’environ 35 donneurs (105 échantillons au total).

· Préparation des librairies de RNA-seq total à partir des mTEC isolées en utilisant le kit SMARTER stranded total RNA-seq. Culture et transfection de la lignée cellulaire mTEC 4D6 avec un vecteur d’expression AIRE pour générer des cellules 4D6-AIRE+. Préparation d’échantillons pour le séquençage RNA-seq total (short et long reads) et le ribo-seq.

· Analyse par cytométrie en flux (FACS) et immunofluorescence des populations cellulaires isolées. Gestion des réactifs, consommables et matériels nécessaires au projet. Contribution à la rédaction de rapports d’avancement et à la valorisation des résultats (publications, présentations).


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Profil

Versant : Fonction publique d’État

Type de recrutement : Catégorie A, contractuel·le, CDD 12 mois (article L.332-2,3 du CGFP)


• Formation et/ou qualification : Le candidat doit posséder un Master 2 ou un diplôme d’ingénieur en biologie cellulaire, immunologie ou biologie moléculaire

• Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : expérience minimale souhaitée de 2 ans