Ingénieur d’études en bio-statistiques (f/h)

À propos de nous

Une université d’excellence

Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).

Une université engagée

En lutte contre toutes les formes de discrimination, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. L’UM place aussi le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.

Structure de rattachement : Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP)

Environnement de travail : Le Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) est situé sur le campus de Baillarguet dans le nord de Montpellier, entre Montferrier-sur-Lez et Prades-le-Lez. Il est composé d’environ 90 agents permanents d’INRAE, de l’IRD, du Cirad et de l’Institut Agro Montpellier. Les recherches qui y sont menées s’inscrivent dans le cadre des impacts liés aux arthropodes phytophages attaquant les cultures et les forêts, aux espèces envahissantes et aux réservoirs de zoonoses, qui pèsent sur la sécurité alimentaire, la biodiversité et la santé. Vous intégrerez l'Axe 3 "Écologie et évolution des zoonoses" qui s'attache à mieux comprendre l’écologie et l’évolution des zoonoses ayant pour réservoirs des petits mammifères sauvages tels que les rongeurs, les musaraignes et les chiroptères. En particulier, vous travaillerez avec un collectif de chercheur.e.s, ingénieur.e.s et technicien.nes dans le cadre du projet RoCoCity.


Mission

Mission principale : Les rongeurs prolifèrent dans les socio-écosystèmes urbains où ils peuvent être en contact étroit avec les humains. En plus de dégâts sur les infrastructures et les ressources alimentaires, ces interactions sont susceptibles de favoriser la transmission de pathogènes zoonotiques vers les habitants et les usagers des espaces urbains. Pour ces raisons, les rongeurs sont souvent la cible de campagnes de gestion, généralement létale (i.e., dératisation) dont les conséquences éco-épidémiologiques restent mal connues. L'objectif du projet RoCoCity est d'explorer l'impact potentiel des actions de dératisation sur les dangers zoonotiques liés aux rongeurs dans différents environnements urbains en France et en Afrique (Bénin, Madagascar, Sénégal). Ce projet permettra (i) de décrypter comment les changements (potentiels) induits par la dératisation au sein des communautés de rongeurs réservoirs auront affecté la présence/absence et la (séro)prévalence de pathogènes zoonotiques portés localement par ces derniers, et (ii) d'informer (dans une perspective de gestion durable) les services en charge du contrôle des rongeurs des risques zoonotiques liés à ces espèces.

Sous les responsabilités de Gauthier DOBIGNY (CR IRD, PI RoCoCity) et Nathalie CHARBONNEL (DR INRAE, N+1 de ce contrat), votre mission consistera à (i) à mettre en œuvre des approches bio-statistiques visant à détecter et quantifier les éventuelles variations temporelles observées dans des communautés multi-hôtes (ici, des rongeurs, des insectivores et leurs ectoparasites) et multi-pathogènes (ici, des bactéries, des virus et des parasites zoonotiques) soumises à des perturbations ponctuelles (ici, des campagnes de gestion) ; et (ii) à optimiser des modèles mécanistes permettant de décrire l’impact de ces perturbations sur les communautés.

Activités :

- concevoir et implémenter des analyses statistiques robustes pour étudier des séries temporelles de données de diversité (hôtes, réservoirs, vecteurs et agents pathogènes) ainsi que prévalence, d’abondance ou d’intensité selon un protocole BACI (i.e. before/after; control/impact) de dératisation.

- Appliquer ces analyses à différents cas d'études (Lyon et Montpellier : jeux de données sur une espèce réservoir, disponibles dès janvier 2026 ; Madagascar : jeu de données sur une communauté d’espèces réservoirs et vectrices, disponibles en mars 2026 ; Bénin et Sénégal : jeux de données sur une communauté d’espèces réservoirs, disponibles vers l’été 2026).

- Améliorer et comparer des modèles mécanistes (ex. modèles épidémiques compartimentaux ou individu-centrés) permettant de modéliser l'impact de la dératisation sur la circulation d'agents pathogènes d'intérêt.

Spécificités / Contraintes du poste : Travail conduit essentiellement devant un poste informatique.


Profil

- Master (Bac+5) ou diplôme d’ingénieur en bio-statistiques, écologie quantitative, éco-épidémiologie ou équivalent.

- Solide expérience en modélisation statistique (GLMM, séries temporelles).

- Maîtrise de l’environnement R et de la manipulation de grands jeux de données.

- Connaissances en traitement de données biologiques (biologie des populations : indices d’abondance ; écologie des communautés : indices de diversité).

- Connaissances en éco-épidémiologie et en modèles mécanistes (SEIR, modèles individu-centrés) appréciées.

- Expérience en analyses de réseaux / co-infections appréciée.

- Intérêt marqué pour le travail d’équipe.

- Bonnes compétences en communication scientifique.

Pourquoi nous rejoindre?

Rejoindre l’université de Montpellier, c’est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.

> Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes

> 2,5 jours de congés payés par mois (pour un temps plein à 35h00)

> Temps de travail aménageable

> Restauration collective

> Aide et prestations sociales

> Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville

> Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l’université

Informations complémentaires :

Rémunération : de 2160€ à 2325€ bruts mensuels, dont 200€ d’indemnité mensuelle des agents contractuels (prime)

Prise de poste : Janvier

Type de contrat : CDD de catégorie A

Durée du contrat : 11,5 mois

Clôture des candidatures : 20/11/2025