Dans le cadre d’un projet INSERM en lien avec les équipes de G. Salgado et Y. Hashem à Bordeaux, E. di Giorgio à Udine, la partie molécules uniques de l’équipe Physique Multi-échelles du vivant du LPENS (J. Valle-Orero, JF Allemand et V. Croquette en lien étroit avec J-B Boulé du MNHN) travaille sur le rôle des G-quadruplexes (G4) dans le promoteur Kras et leurs liens avec la régulation transcriptionnelle du gène dans les cellules cancéreuses.
L’implication de la partie molécule unique du consortium consiste à utiliser des pinces magnétiques pour déterminer les cinétiques de formation des 3 potentiels G4 pouvant se former sur ce promoteur et l’interaction éventuelle entre les G4s et avec des protéines interagissant avec le promoteur et susceptibles d’avoir un effet sur les G4s. Pour cela nous utilisons un protocole développé au laboratoire permettant de former des G4s dans un contexte double brin de hairpins comme décrit dans la référence : https://doi.org/10.1093/nar/gkab306
Nous cherchons un(e) ingénieur(e) d’étude pour mener ces recherches.
Activités
-mesure de cinétique de formation de structures de G4 avec des pinces magnétiques en tâche principale.
-biologie moléculaire pour mettre en place les expériences en tache secondaire
-participer à l'analyse des données.
Compétences
Une expérience dans la manipulation de molécules uniques est nécessaire (pinces optiques ou magnétiques, mais de préférence magnétiques).
La personne recrutée devra avoir en plus les compétences indispensables en biologie moléculaire pour construire les hairpins nécessaires aux expériences. La personne recrutée pourra également être amenée à purifier les protéines susceptibles d’interagir avec les structures formées dans le groupe de J-B Boulé au MNHN.
Contexte de travail
La personne recrutée devra, sous l’encadrement des permanents du groupe, mener les expériences pour déterminer les temps de formation des différents G4s, de certains de leurs mutants, voir l’effet de la présence d’oxoguanines à certaines positions. L’effet de protéines interagissant avec le promoteur sera étudié pour voir leur influence sur la stabilité des G4s.
La personne recrutée devra, sous l’encadrement des permanents du groupe, mener les expériences pour déterminer les temps de formation des différents G4s, de certains de leurs mutants, voir l’effet de la présence d’oxoguanines à certaines positions. L’effet de protéines interagissant avec le promoteur sera étudié pour voir leur influence sur la stabilité des G4s.
Contraintes et risques
Risques biologiques classiques en biologie moléculaire
Risques biologiques classiques en biologie moléculaire
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