Ingénieur-e en ingénierie logicielle

Présentation d'INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement, est un organisme public de recherche qui réunit collaborateurs au sein de 272 unités réparties sur 18 centres en France. Premier organisme mondial spécialisé sur l'ensemble agriculture – alimentation – environnement, INRAE joue un rôle clé pour accompagner les transitions nécessaires face aux grands défis planétaires.

Face à l'augmentation de la population, aux enjeux de sécurité alimentaire, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE s'engage à développer des solutions scientifiques et à accompagner l'évolution des pratiques agricoles, alimentaires et environnementales.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein du Centre national de ressources génomiques végétales (CNRGV). Le CNRGV est une unité de service INRAE dépendant du département de Biologie et amélioration des plantes (BAP) composée d'une vingtaine de personnes. C'est une infrastructure nationale, labellisée infrastructure scientifique collective, qui accompagne des projets de recherche en génomique végétale dans le cadre de programmes nationaux ou internationaux visant à comprendre l'évolution et l'adaptation des plantes par l'étude de la structure de leurs génomes.

Le Système d'information (SI) dédié du CNRGV est un élément clé pour mener à bien ces missions. Il assure la gestion globale de l'activité du laboratoire, ainsi que l'analyse bio-informatique des données de génomique. Ce SI est composé d'applications web développées en interne, de pipelines d'analyses et d'infrastructures de calcul performantes. Les traitements bioinformatiques consistent à analyser et à donner du sens aux données de séquences d'ADN ou d'ARN issues des séquenceurs de dernières générations.

Vous serez intégré dans l'équipe informatique, composée de quatre personnes. Vous travaillerez en liaison directe avec le responsable informatique et en relation permanente avec les autres membres de l'équipe informatique et de l'ensemble du personnel réalisant les expériences de génomique.

Vous travaillerez sur le campus INRAE de Toulouse, au coeur de l'écosystème de la recherche en biologie au contact des chercheurs et ingénieurs.

Développement Et Maintenance Logicielle

Vous concevrez, développerez et testerez des logiciels en respectant les normes et règles de sécurité
Vous assurerez la maintenance évolutive et corrective des outils existants
Vous préparerez et déploierez les applications en garantissant la gestion des versions
Vous rédigerez et mettrez à jour la documentation technique et fonctionnelle.

Mise En Place D'outils Et Pipelines Bio-informatiques

Vous développerez et intégrerez des pipelines d'analyse pour la génomique végétale
Vous piloterez le déploiement de ces outils et pipelines, assurerez l'assistance aux utilisateurs et formerez l'équipe.

Veille Technologique Et Amélioration Continue

Vous identifierez et intégrerez les nouvelles technologies, notamment issues des développements de l'intelligence artificielle (IA), pour optimiser les outils du laboratoire.

Vous Serez En Charge De

Modéliser, concevoir et/ou paramétrer tout ou partie de la solution logicielle
Concevoir et mettre en oeuvre des pipelines d'analyse bioinformatique
Développer et tester les objets et composants, packager des applications
Assurer la maintenance évolutive et curative des développements réalisés, en assurant le suivi des versions
Rédiger et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles
Contribuer à la mise en place et au respect des dispositions qualité et des normes
Élaborer des stratégies de tests, concevoir, spécifier et exécuter des tests fonctionnels et/ou techniques
Créer et tester les packages applicatifs et les scripts de déploiement en production
Assurer une assistance fonctionnelle et/ou technique aux utilisateurs
Faire de la veille et proposer les technologies et outils pertinents pour améliorer les solutions existantes
Concevoir les actions de formation techniques et fonctionnelles.

La réussite à ce concours vaut qualification informatique. Le poste ouvre droit à une prime informatique en qualité d'analyste.

Formations et compétences recherchées

Licence, Licence professionnelle, Maîtrise, Master 1, BUT (niveau 6 minimum)

Compétences générales

Génie logiciel
Effectuer une analyse de besoins
Piloter un projet
Rédiger et mettre à jour la documentation fonctionnelle et technique
Élaborer et mettre en oeuvre un plan de tests (maîtrise)
Appliquer les normes, procédures et règles
Sens de l'organisation
Rigueur / Fiabilité.

Formation Recommandée

Formation en informatique ou bioinformatique.

Détail des compétences, savoirs et expériences recherchés :

Compétences Techniques

Maîtrise du développement logiciel (langages Java, Python, JavaScript, Bash)
Connaissance de frameworks de type SpringBoot, React ou Biopython
Gestion des projets (Git/GitLab)
Maitrise de la ligne de commande
Gestionnaire de workflow Nextflow ou Snakemake
Système de gestion de bases de données (PostgreSQL et langage de requête SQL)
Des compétences en administration système seraient un atout supplémentaire.

Savoir Généraux

Rédiger la documentation
Maîtriser l'anglais technique
Présenter et vulgariser des résultats

Savoir-être

Gout du travail en équipe
Capacité à interagir avec des utilisateurs biologistes
Rigueur et conscience professionnelle
Sens de l'organisation
Curiosité pour la veille technologique dans les domaines de compétences informatique, intelligence artificielle (IA) et bioinformatique.

Votre qualité de vie à INRAE

En Rejoignant INRAE, Vous Bénéficiez

de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
d'activités sportives et culturelles ;
d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Je télécharge le guide Guide des candidats pdf Mo
Je note le numéro du profil IE26-BAP-4
Je postule Espace d'inscription

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l'obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l'exercice de leurs fonctions, qu'elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu'elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction