Ingénieur.e biologiste en laboratoire

À propos de nous

Nantes Université est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d’université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) ainsi que Centrale Nantes, l’école des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire et l’École Nationale Supérieure d’Architecture de Nantes.

Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l’excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations, dans tous les domaines de la connaissance.

Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d'études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon.


Mission

Environnement et contexte de travail

•Localisation : Nantes

L’unité mixte de recherche US2B (Unité en Sciences Biologiques et Biotechnologies, en cotutelle avec Nantes Université et le CNRS) est structurée autour de 5 équipes de recherche, d'une plateforme expérimentale et d'une cellule de compétences. Le poste est à pourvoir au sein de l’équipe 5 «Epigénomique des microalgues et interactions avec l'environnement» dirigée par Leïla Tirichine. L’équipe s’intéresse à la réponse moléculaire, et en particulier épigénétique, des microalgues à leur environnement. Au sein de cette équipe, la personne recrutée travaillera principalement avec Céline Duc, qui s’intéresse notamment à la conservation fonctionnelle des variants d’histones H2A entre les micro et macroalgues brunes.

Missions

Dans le cadre d’un financement ANR PRC, la personne recrutée aura pour but de caractériser le rôle des histones H2A d’algues brunes dans le contexte de l’augmentation de la température marine via l’étude (i) de l’impact de l’absence d’une isoforme d’histone H2A sur la croissance et la réponse au stress thermique et (ii) la distribution génomique des variants H2A chez P. tricornutum et (ii) la conservation fonctionnelle des variants d’histone H2A d’Ectocarpus chez P. tricornutum. Ses missions seront de mettre en œuvre, dans le cadre de protocoles établis, des techniques de biologie cellulaire et moléculaire et de biochimie pour la préparation, la caractérisation et l’étude d’échantillons biologiques et d’organiser la collecte, le traitement et l’analyse de données génomiques.

Activités principales

Conduire, dans le cadre d’un programme expérimental, un ensemble de techniques de biologie

•Réalisation, en conditions stériles, des cultures de microalgues

•Réalisation de mutants perte-de-fonction par la technologie CRISPR-Cas9

Prélever et conditionner des échantillons en vue d’une expérimentation

•Utilisation de la technique de ChIP-Seq pour quantifier l’abondance et la localisation des histones à l’échelle nucléosomale, en vue d’une approche de séquençage global

•Utilisation de la technique de RNA-Seq pour quantifier l’expression du génome en vue d’une approche de séquençage global

Assurer la gestion et le traitement des données de séquençage

•Mettre en place et optimiser les procédures de recueil et de contrôle des données

•Réaliser le traitement des données génomiques

•Organiser la mise en forme et le stockage des données génomiques

Consigner, mettre en forme et présenter les résultats

•Utiliser un cahier de laboratoire pour archiver les travaux

•Présenter des résultats pendant les réunions d’équipe

Assurer la gestion des stocks

•Conserver et suivre les mutants obtenus

•Participer au repiquage des microalgues étudiées

Retrouvez l'intégralité de la fiche de poste ici :


Profil

• Formation et/ou qualification : Bac+5

• Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : en biologie et si possible, en bio-informatique