Le/La postdoctorant-e consacrera son temps à l’identification de microprotéines dans des échantillons biologiques de sérum de patients atteints d'un cancer du pancréas à différent stades. Ceci implique notamment la mise en place de méthodes d’extraction spécifiques des microprotéines couplées à des analyses par spectrométrie de masse.
Il/elle participera aux études de caractérisation fonctionnelle de ces microprotéines en collaboration avec l’équipe d’Yvan Martineau au CRCT à Toulouse.
Activités
- Enrichissement de microprotéines à partir de sérum.
- Analyse des échantillons produits par spectrométrie de masse.
- Design de librairies de peptides synthétiques pour la validation des données de spectrométrie de masse.
Compétences
- Enrichissement de microprotéines (prérequis).
- Protéomique et spectrométrie de masse pour l’analyse des microprotéines (prérequis).
- Analyse bioinformatique dédiée à l’identification et la quantification de microprotéines par spectrométrie de masse (prérequis).
- Dosage de protéines (notions, formation interne possible).
Contexte de travail
L’institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS) est une unité mixte de recherche du CNRS et de l’Université de Toulouse localisée sur le site de Rangueil au sud de Toulouse. L'objectif principal de L’IPBS est l'identification, la caractérisation et l'exploitation de nouvelles cibles thérapeutiques dans les domaines du cancer, de l'infection et de l'inflammation. Le projet s’inscrit dans le domaine du cancer du pancréas. Plus particulièrement il consiste en une étude qui vise à caractériser les microprotéines dans ce cancer afin d’estimer leur potentiel en tant que nouvelles cibles thérapeutiques ou nouveaux biomarqueurs précoces de la pathologie. Ce projet ambitieux repose sur la collaboration de 2 équipes, l’équipe « Protéomique et spectrométrie de masse des biomolécules (Eq. O. Schiltz) à l’IPBS et l’équipe « MICROPANC » (Eq. C. Bousquet) au CRCT. Ce poste s’inscrit plus précisément dans les études conduites par B. Fabre (Eq. O. Schlitz, IPBS) Y. Martineau (Eq. C. Bousquet, CRCT) et nécessite de la part du candidat-e des qualités de communication.
L’institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS) est une unité mixte de recherche du CNRS et de l’Université de Toulouse localisée sur le site de Rangueil au sud de Toulouse. L'objectif principal de L’IPBS est l'identification, la caractérisation et l'exploitation de nouvelles cibles thérapeutiques dans les domaines du cancer, de l'infection et de l'inflammation. Le projet s’inscrit dans le domaine du cancer du pancréas. Plus particulièrement il consiste en une étude qui vise à caractériser les microprotéines dans ce cancer afin d’estimer leur potentiel en tant que nouvelles cibles thérapeutiques ou nouveaux biomarqueurs précoces de la pathologie. Ce projet ambitieux repose sur la collaboration de 2 équipes, l’équipe « Protéomique et spectrométrie de masse des biomolécules (Eq. O. Schiltz) à l’IPBS et l’équipe « MICROPANC » (Eq. C. Bousquet) au CRCT. Ce poste s’inscrit plus précisément dans les études conduites par B. Fabre (Eq. O. Schlitz, IPBS) Y. Martineau (Eq. C. Bousquet, CRCT) et nécessite de la part du candidat-e des qualités de communication.
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