Ingénieur de recherche en épigénétique de la mémoire immunitaire innée chez l’huitre creuse (h/f)

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche en épigénétique de la mémoire immunitaire innée chez l’huitre creuse (H/F)
Référence : UMR5244-CELCOS-003
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PERPIGNAN
Date de publication : lundi 3 novembre 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 19 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2026
Quotité de travail : Complet
Rémunération : à partir de 3 175.08 euros mensuels bruts, ajustable selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingenieure ou ingenieur biologiste en laboratoire

Missions

La personne recrutée aura pour mission d'étudier le rôle des mécanismes épigénétique dans la mémoire immunitaire innée chez l'huître creuse Crassostrea gigas.

Activités

La personne recrutée conduira un projet de recherche visant à explorer les mécanismes épigénétiques impliqués dans la mémoire immunitaire innée de l’huître. Plus spécifiquement, ses missions consisteront à :
-Développer et optimiser des approches d’analyse des marques épigénétiques (modifications des histones, méthylation de l’ADN, structure chromatinienne) dans les hémocytes, les cellules immunitaires de l’huître ;
-Étudier l’évolution de ces marques épigénétiques à court et long terme chez des individus ayant subi une stimulation de leur mémoire immunitaire innée ;
-Analyser les données générées à l’aide d’approches bioinformatiques et statistiques adaptées.
-Intégrer les résultats obtenus aux approches multi-omiques développées dans le cadre du projet ANR PRIMoyster (notamment transcriptomique et métabolomique) afin d’explorer les liens entre épigénétique, expression génique et métabolisme.
-Rédiger des articles scientifiques et présenter les résultats lors de congrès nationaux et internationaux.
-Explorer les applications potentielles en aquaculture et en santé animale, notamment en lien avec l’amélioration des stratégies de gestion sanitaire des huîtres.
-Évaluer dans quelle mesure les concepts actuels de l’épigénétique peuvent apporter un éclairage sur les interactions entre mémoire immunitaire innée et expression génique.
En complément de ces travaux, la personne recrutée participera activement aux activités collectives de l’unité, incluant les séminaires, réunions de travail et échanges scientifiques au sein du laboratoire.

Compétences

Le candidat H/F devra posséder une expérience associée en immunologie analyses multi-omics ou un domaine connexe. Une expérience en traitements de données pour l’analyse du séquençage haut débit sont recherchées. Un bagage conceptuel en immunité des invertébrés et une ouverture pour l’épigénétique seront appréciés. Goût affirmé pour le travail en équipe et aptitude à interagir avec des collaborateurs dans le cadre d’un projet national. Une expérience dans la rédaction d’articles scientifiques et dans les présentations orales scientifiques est nécessaire.

Contexte de travail

Le projet sera développé au sein de l'UMR IHPE, qui utilise des approches multi-échelles (des molécules aux populations naturelles) pour étudier les mécanismes (moléculaires, évolutifs) régissant les interactions entre les hôtes, leurs agents pathogènes et leurs environnements.
Notre objectif est d'acquérir une compréhension intégrée de l'émergence des agents infectieux, de leurs dynamiques évolutives, de leur apparition et de leur extinction dans les milieux naturels, afin de contribuer au développement d'une approche globale de la santé résumée par « Une Planète – Une Santé – Un Océan ».
Notre unité est reconnue au niveau national et international pour ses contributions dans les domaines de l'aquaculture, des récifs coralliens et des maladies tropicales négligées. Nous mettons un accent particulier sur la création de synergies entre tous les membres de l'UMR et avec nos collaborateurs nationaux et internationaux (Amérique du Sud, Afrique et Océanie/Pacifique), ainsi que sur la Qualité de Vie et des Conditions de Travail (QVCT) et l'égalité des chances.
Notre unité est implantée sur deux sites : Perpignan et Montpellier. Nous travaillons également sur les infrastructures de l'Ifremer à Sète et Palavas. Les activités de l'agent recruté (H/F) seront principalement basées à Perpignan, avec des déplacements à Montpellier.
Ce projet sera réalisé dans le cadre du projet ANR Primoyster (voir site Internet : /Projet-ANR-22-CE20-0017). Ce projet vise à développer une méthode innovante de prévention d'une virose chez l'huître creuse Crassostrea gigas, en se basant sur les propriétés du priming immunitaire (PI), un phénomène de mémoire immunitaire innée. Le priming immunitaire, également appelé immunité entraînée, a été mis en évidence au cours des deux dernières décennies chez diverses espèces d'invertébrés et de vertébrés, et peut être décrit comme la capacité du système immunitaire inné à générer une mémoire immunitaire indépendante des antigènes, offrant une réponse amplifiée lors d'un second contact avec un agent pathogène ou ses constituants. Alors qu'un nombre croissant d'études explorent le phénomène de priming immunitaire, la compréhension de ses fondements mécaniques est actuellement très fragmentaire chez les invertébrés. En outre, de nombreuses études chez les vertébrés, les invertébrés et les plantes mettent en évidence le rôle clé de la reprogrammation épigénétique et métabolique à long terme des cellules immunitaires innées, qui apparaît comme un dénominateur commun de la mémoire immunitaire innée chez toutes les espèces. Il s'appuie sur les dernières avancées développées au laboratoire sur la mémoire immunitaire innée chez les mollusques et sur des approches multi-omiques intégratives pour explorer les bases cellulaires, moléculaires, épigénétiques et métaboliques du priming immunitaire, offrant ainsi une nouvelle perspective sur la compréhension de la réponse immunitaire des bivalves. Cette approche pourrait offrir une alternative durable et éthique aux méthodes prophylactiques actuelles, peu efficaces face à la prolifération des pathogènes en lien avec le changement climatique.

Contraintes et risques

Le laboratoire IHPE se trouve sur 2 sites géographiques. la personne recrutée effectuera ces travaux essentiellement sur le site de Perpignan mais devra régulièrement voyager à Montpellier pour réaliser des expériences, assister à des réunion et échanger avec les autres partenaires de l'ANR.
Le laboratoire site Perpignan LSB2 et site Montpellier de sécurité microbiologique de niveau 2 nécessitant d’appliquer les règles d’hygiène et de sécurité en particulier pour les risques chimiques et biologiques. Port obligatoire des équipements de protection Le candidat H/F recevra toute la formation technique prévue par la loi. Travail sur écran.