A l’aide d’outils issus de la bio-informatique et avec l’assistance de l’équipe, vous développerez ou adapterez des méthodes pour :
o Créer un catalogue décrivant les introgressions observable à l’aide de données de séquençage (couverture et fréquence de SNP).
o Faire le lien avec les introgression connues et utilisées par les sélectionneurs.
o Evaluer la faisabilité de l’identification de l’origine de ces introgression à l’aide d’haplotypes (SNPs) spécifique de la source d’introgression (ancêtres ou espèces apparentées).
o Ce travaille pourra éventuellement conduire au développement de nouveaux marqueurs KASP spécifique d’introgressions responsables de certains traits afin d’améliorer les marqueurs actuellement utilisés et d’envisager de mieux évaluer suivre et réduire la taille des introgression utilisés dans les lignées de sélection.
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