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Ingénieur de recherche en bioinformatique (f/h)

Montpellier
CDD
Université de Montpellier
Ingénieur de recherche
De 2 405 € à 3 265 € par mois
Publiée le Il y a 10 h
Description de l'offre

RESPONSABILITÉS :

Mission principale : Le candidat ou la candidate sera impliqué principalement dans l'analyse de données de transcriptomique (RNAseq, scRNAseq, ...), protéomique et métabolomique. Il ou elle devra développer un pipeline d'analyses et des outils pour l'intégration des données. Il ou elle sera également amené(e) à réaliser des méta-analyses sur les données de la littérature.
Une expérience en codage bash, R et python et dans l'utilisation d'outils d'analyses bioinformatiques est demandée. De même, une expérience d'outils de type snakemake ou nextflow, de l'utilisation de serveurs de calculs ou d'analyses de données sur cellules uniques sera un élément pris en compte dans l'examen de la candidature. Un bagage en modélisation mathématique serait également appréciable.

PROFIL RECHERCHÉ :

Qualifications / Domaine de formation demandé :
Compétences scientifiques et Techniques :
- Maîtrise de la programmation en Python, R et Shell / Bash.
- Savoir rechercher et utiliser les différentes informations et outils logiciels publics
- Collecter, analyser, traiter et visualiser des données
- Utiliser des bibliothèques communes d'analyse de données et de bio-informatique (Seurat, scanpy, monocle, pandas, etc.)
- Expertise dans l'analyse statistique et la construction de workflows.
- Capacité avérée à gérer et analyser, intégrer et interpréter des données issues des diverses techniques d'analyse -omique
- Mise au point de protocoles informatiques originaux pour l'analyse des données
- Bonne connaissance de la biologie

Compétences opérationnelles :
- Titulaire d'un Master en bioinformatique, biostatistique ou biomathématique.
- Suivi et communication des résultats sous forme de rapport, publication et présentation orales
- Bonne communication avec les chercheurs en biologie, ouverture d'esprit et intérêt pour les questions biologiques
- Capacité de transmission des connaissances
- Aptitude au travail en équipe, capacités d'écoute et de proposition, autonomie.
- Capacité à communiquer en anglais à l'oral et à l'écrit

Rejoindre l'université de Montpellier, c'est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.

Nos avantages :
> Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes
> Jusqu'à 46 jours de congés / an (pour un temps plein à 38h30)
> Temps de travail aménageable
> Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM)
> Restauration collective
> Aide et prestations sociales
> Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville
> Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université
> Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade
Avantages dépendant de la nature et la durée du contrat, des nécessités de services et des conditions d'éligibilité

Informations complémentaires :
Rémunération : de 2405€ à 3265€ bruts mensuels, dont 200€ d'indemnité mensuelle des agents contractuels (prime)
Prise de poste : Janvier
Type de contrat : CDD de catégorie A
Durée du contrat : 12 mois
Clôture des candidatures : 28/11/2025

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