Mission :
Dans le contexte d'un plateau de microscopie fonctionnant en laboratoire confiné de sécurité biologique de niveau 3 (NSB3) sur la plateforme d'infectiologie CEMIPAI, l'ingénieur de recherche organisera le service d'imagerie photonique 4D en lien avec les autres services et les utilisateurs de la plateforme. En particulier, il participera à la mise en place, au développement, à l'entretien des microscope Lattice Light Sheet et Spinning-Disk du plateau NSB3. Il accompagnera, formera, conduira et développera en spécialiste les acquisitions et les traitements d'image adaptés aux questions scientifiques et techniques posées par les utilisateurs.
Activités :
• Mettre en place un nouveau service de microscopie volumétrique dans le laboratoire NSB3 via l'installation et la mise en exploitation d'un nouveau microscope Lattice Light Sheet (LLSM) dédié à l'imagerie 4D de cultures cellulaires 2D & 3D, sphéroïdes, organoïdes et organismes modèles en trois dimensions.
• Assurer le support technique, accompagner et former les utilisateurs sur le microscope spinning-disk, en lien avec leurs questions biologiques.
• Assurer le bon fonctionnement du parc des microscopes volumétriques (LLSM et Spinning-Disk) ainsi que le développement de l'offre de prestations
• Accompagner et initier des projets en microscopie du vivant infectieux en microscopie volumétrique LLSM et Spinning-Disk en NSB3
• Organiser et faire évoluer l'offre, le parc matériel et logiciel, la gestion et la facturation du service
• Assurer les bonnes conditions d'utilisation et de sécurité pour les utilisateurs et les appareils en environnement NSB3
• Implémenter de nouvelles modalités d'imagerie volumétrique, particulièrement le déploiement de solutions dédiés aux cultures cellulaires 3D, organoïdes et embryons (de l'acquisition à l'analyse des données) et leur utilisation dans des recherches en infectiologie, de l'exposome et de leur combinaison.
• Mettre en œuvre des méthodes d'analyse de traitement du signal et de traitement d'images pour répondre aux besoins de recherche des utilisateurs
• Développer et réaliser des contrats de prestations privés et publics
• Participer à des réseaux professionnels d'échanges et de savoir-faire techniques dans le domaine de la microscopie volumétrique
• Assurer une veille scientifique et technologique et participer aux réseaux métiers (GDR, FBI, EUBI)
• Gérer, maintenir et faire évoluer le parc matériel et logiciel, suivre quotidiennement l'exploitation
• Rédiger des rapports d'expérience ou de prestation, des notes techniques
• Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité en environnement NSB3
• Diffuser et valoriser les résultats des développements méthodologiques par des présentations orales, la production de publications…
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