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Stage analyse intégrée multi-omique des flux d’antibiorésistance dans les step corrélation des données chimiques, microbiologiques et génomiques

Maisons-Laffitte
Stage
Veolia
Publiée le 2 novembre
Description de l'offre

Description du poste


Le stage est à pourvoir au sein de l'équipe Monitoring et Caractérisation Biologique (MCB)

Titre du stage : Analyse du rôle des STEP dans les flux d'antibiorésistance à l'échelle des bassins versants

Dans le contexte marqué par l'urgence de lutter contre l'antibiorésistance (AR), de nouvelles exigences européennes imposent une surveillance des STEP >100 000 EH au regard de leur qualification comme points chauds de convergence des eaux usées chargées en bactéries résistantes, bactéries pathogènes et en résidus d'antibiotiques. Le/la stagiaire aura pour mission de développer une stratégie d'exploitation des données existantes (chimie, microbiologie, génomique) pour analyser le rôle des STEP dans les flux d'antibiorésistance à l'échelle des bassins versants et identifier les facteurs déterminants de cette propagation.. L'objectif est de compiler et structurer ces données hétérogènes, puis d'établir des corrélations entre les paramètres opérationnels et les données biologiques pour identifier les facteurs clés influençant les flux d'antibiorésistance.



Missions principales :

* Recherche bibliographique : Réaliser une revue de la littérature sur l'antibiorésistance dans les STEP et les bassins versants, la gestion des données (format, métrique en lien avec la réglementation européenne)

* Compilation et structuration des données : Collecter, organiser et harmoniser les données existantes (chimie, microbiologie, génomique) et leurs métadonnées associées

* Analyse de corrélations : Corréler les données de séquençage avec les analyses chimiques et microbiologiques pour identifier les relations entre paramètres et comprendre les mécanismes de transfert horizontal de gènes

* Valorisation des résultats : Développer des visualisations et synthèses permettant d'interpréter le rôle des STEP dans les flux d'antibiorésistance à l'échelle des bassins versants




Qualifications


Formation : Etudiant(e) en Bac+4/5 (Master 1 ou 2) en biotechnologie, Bioinformatique, Data Science, Data Management

Vos compétences :

* Compétences en analyse de données et programmation (Python, R)

* Connaissances en microbiologie et/ou génomique appréciées

* Capacités d'analyse bibliographique et de synthèse

* Visualisation de données : Looker Studio, Tableau

* Familiarité avec les formats de données courants en biologie (fastq, pcrd, images, tables, texte, etc.)

Vos qualités, votre savoir-être :

Communication : Bonne expression orale et écrite en français

Culture sécurité, rigueur, capacité à travailler en équipe, dynamisme, bon esprit de synthèse, force de proposition / prise d’initiative, sens de l’organisation









Informations supplémentaires




Nos valeurs :
Responsabilité, Respect, Solidarité, Innovation, Sens du client

Environnement de travail:

* Environnement stimulant

o team buildings, créativité, innovation

o croisement des expertises et des disciplines

o des sujets de travail renouvelés pour découvrir et grandir

o une vision large des enjeux et des activités de Veolia pour ressourcer le monde

o un accompagnement pour se développer professionnellement

o les opportunités d’évolution au sein d’un groupe mondial



En tant qu'entreprise inclusive, Veolia s’engage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures, sans discrimination.

Pour postuler merci de joindre dans l'onglet “pièces jointes” CV et lettre de motivation en format PDF (nommés de la manière suivante : Nom Prénom_CV et Nom Prénom_LM)



En tant qu'entreprise inclusive, Veolia s’engage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures, sans discrimination.

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