En coordination avec le chef de l'équipe DEEVA, l'agent propose et teste des stratégies expérimentales d'inactivation génique chez plusieurs espèces d'ascidie. Il est en charge, en utilisant ces technologies, de la mise en oeuvre d'un volet du projet ANR 2023 PnsEvo.
Activités
- Mettre au point les technique de micro-injection d'ovocytes chez les différentes espèces cibles du projet.
- Choisir, adapter et valider les protocoles d'inactivation génique par la technologie CRISPR/Cas9 (design, génotypage, phénotypage).
- Mettre en oeuvre ces approches sur une sélection de gènes cibles. Phénotyper, interpréter et comparer les résultats obtenus chez les différentes espèces.
- Exploiter et présenter les résultats des analyses, en garantir la qualité.
- Rédiger des protocoles et des publications scientifiques.
- Gérer les moyens techniques dans le cadre projet ANR 2023 PnsEvo.
- Conduire l'appareillage dédié à l'approche méthodologique et en assurer le fonctionnement.
- Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité.
Compétences
Compétences principales
- Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires
- Connaissance approfondie de la biologie du développement.
- Connaissance générale de la biologie.
- Savoirs sur l'environnement professionnel
- Les communautés technologiques du domaine.
- Les réglementations du domaine en hygiène et sécurité.
- Les principes éthiques et les réglementations afférentes.
- Savoir-faire opérationnels
- Utiliser des instruments dédiés à l'analyse et l'expérimentation en biologie (électrophorèse, micro-manipulateur et micro-injecteur, stéréomicroscope, microscope confocal, caméra numérique) et en assurer la maintenance.
- Mettre en oeuvre des expériences de biologie du développement et imagerie du vivant.
- Utiliser les outils informatiques et des logiciels dédiés au traitement de données de séquence et à l'analyse d'image.
- Situer son activité dans la thématique et les projets scientifiques de l'unité.
- Maîtriser les techniques de présentations orales et écrites.
- Compréhension écrite et orale en anglais.
Compétences associées
- Connaissance générale des disciplines voisines (mathématiques, physique, chimie).
- Notions de base en bioinformatique.
- Rédiger des rapports.
- Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs internes et externes.
Formations et expérience professionnelle souhaitables
- Domaine de formation : biologie.
- Expérience exigée en biologie moléculaire et en biologie du développement.
- Expérience souhaitable en imagerie et/ou sur des organismes modèles non-conventionnels.
Contexte de travail
L'agent sera affecté dans l'unité Biologie Intégrative des Organismes Marins (UMR7232) dirigée par Hector ESCRIVA. Le BIOM est une des unités constituantes de l'Observatoire Océanologique de Banyuls-sur-mer (FR3274) qui a pour missions la recherche, l'enseignement, l'observation, l'accueil scientifique, la médiation scientifique et le développement économique dans les domaines des sciences de la mer. L'agent travaillera dans l'équipe DEveloppement et EVolution des Ascidies' dirigée par Sébastien DARRAS. Cette équipe étudie les mécanismes cellulaires et moléculaires contrôlant l'embryogenèse d'un modèle animal marin, l'ascidie. L'agent aura un rôle majeur dans la réalisation d'un projet novateur PnsEvo dans le cadre de l'appel d'offre 2023 de l'ANR.
Contraintes et risques
Le modèle d'étude, l'embryon d'ascidie, peut imposer des contraintes horaires nécessitant occasionnellement de travailler en dehors des horaires habituels (dans la soirée).
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