La plateforme GenomEast, hébergée à lInstitut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC) et membre de linfrastructure nationale « France Génomique » fournit une expertise, des services, et réalise des développements en transcriptomique, épigénétique et génomique pour lensemble de la communauté scientifique nationale et internationale.
En collaboration avec le service dhistopathologie de la Clinique de la Souris, la plateforme dimagerie de lIGBMC et le projet européen de collaboration P4Health, GenomEast souhaite aujourdhui renforcer son activité de transcriptomique spatiale en recherche fondamentale et translationnelle.
Activités
1. Gérer les prestations de service en vigueur sur la plateforme
2. Piloter les projets de développement (conception, mise en œuvre, suivi, analyse, compte rendu)
3. Conduire la mise en production des nouveaux développements retenus
4. Diffuser et valoriser les résultats des projets de développement auprès des collaborateurs de la plateforme et au sein des réseaux professionnels auxquels elle appartient (site internet, poster, présentation orale, publication)
5. Réaliser une veille scientifique et technologique en lien avec la transcriptomique spatiale
6. Préparer des protocoles détaillés et établir des procédures opératoires standardisées (SOP) pour la réalisation des études de transcriptomique spatiale et garantir une analyse et un reporting de haute qualité
7. Définir les contrôles qualité nécessaires aux différentes étapes des expérimentations
8. Collaborer avec les équipes scientifiques et les acteurs des institutions partenaires P4Health pour adapter les méthodologies en fonction des résultats des projets et des défis émergents
9. Fournir un accompagnement scientifique et un support de dépannage aux équipes et aux partenaires P4Health
10. Garantir une documentation adéquate et une traçabilité complète des activités des projets, à des fins daudit et dévaluation, conformément aux standards FAIR
Compétences techniques
Connaissances
11. Bonnes connaissances en histopathologie et en techniques dimagerie
12. Connaissances générales en biologie cellulaire et moléculaire
13. Connaissances de base des approches en transcriptomique, génomique et/ou épigénétique par séquençage à haut débit
14. Connaissance du fonctionnement des plateformes de recherche en sciences du vivant
15. Maîtrise de langlais scientifique à loral et à lécrit
16. Connaissance générale de la Norme ISO 9001
Compétences opérationnelles
17. Expérience significative en histologie, Immunomarquage et microscopie à fluorescence
18. Expérience pratique de la gestion et de lanalyse dimages microscopiques (Exemple Image J)
19. Maîtrise des techniques générales de biologie moléculaire (extraction, purification, hybridation, marquage, amplification dacides nucléiques)
20. Une première expérience sur le pilotage dun séquenceur Illumina ou sur la préparation de banque de séquençage haut débit serait un plus.
Compétences comportementales
21. Capacité de synthèse et de présentation à loral et à lécrit.
22. Capacité à transmettre un savoir-faire technique
23. Aptitude au dialogue avec des scientifiques issus de différents domaines
24. Rigueur et organisation
25. Sens du service
26. Respect des règles de déontologie et de confidentialité
27. Planification et gestion des priorités
28. Esprit critique et curiosité scientifique
29. Travail en équipe
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