Dans le contexte d'un plateau de microscopie fonctionnant en laboratoire confiné de sécurité biologique de niveau 3 (NSB3) sur la plateforme d'infectiologie CEMIPAI, l'ingénieur de recherche organisera le service d'imagerie photonique 4D en lien avec les autres services et les utilisateurs de la plateforme. En particulier, il participera à la mise en place, au développement, à l'entretien des microscope Lattice Light Sheet et Spinning-Disk du plateau NSB3. Il accompagnera, formera, conduira et développera en spécialiste les acquisitions et les traitements d'image adaptés aux questions scientifiques et techniques posées par les utilisateurs.
Activités
- Mettre en place un nouveau service de microscopie volumétrique dans le laboratoire NSB3 via l'installation et la mise en exploitation d'un nouveau microscope Lattice Light Sheet (LLSM) dédié à l'imagerie 4D de cultures cellulaires 2D & 3D, sphéroïdes, organoïdes et organismes modèles en trois dimensions.
- Assurer le support technique, accompagner et former les utilisateurs sur le microscope spinning-disk, en lien avec leurs questions biologiques.
- Assurer le bon fonctionnement du parc des microscopes volumétriques (LLSM et Spinning-Disk) ainsi que le développement de l'offre de prestations
- Accompagner et initier des projets en microscopie du vivant infectieux en microscopie volumétrique LLSM et Spinning-Disk en NSB3
- Organiser et faire évoluer l'offre, le parc matériel et logiciel, la gestion et la facturation du service
- Assurer les bonnes conditions d'utilisation et de sécurité pour les utilisateurs et les appareils en environnement NSB3
- Implémenter de nouvelles modalités d'imagerie volumétrique, particulièrement le déploiement de solutions dédiés aux cultures cellulaires 3D, organoïdes et embryons (de l'acquisition à l'analyse des données) et leur utilisation dans des recherches en infectiologie, de l'exposome et de leur combinaison.
- Mettre en oeuvre des méthodes d'analyse de traitement du signal et de traitement d'images pour répondre aux besoins de recherche des utilisateurs
- Développer et réaliser des contrats de prestations privés et publics
- Participer à des réseaux professionnels d'échanges et de savoir-faire techniques dans le domaine de la microscopie volumétrique
- Assurer une veille scientifique et technologique et participer aux réseaux métiers (GDR, FBI, EUBI)
- Gérer, maintenir et faire évoluer le parc matériel et logiciel, suivre quotidiennement l'exploitation
- Rédiger des rapports d'expérience ou de prestation, des notes techniques
- Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité en environnement NSB3
- Diffuser et valoriser les résultats des développements méthodologiques par des présentations orales, la production de publications
Compétences
- Connaissances théoriques et pratiques approfondies en microscopie volumétrique par feuille de lumière structurée (lattice light sheet) et microscopie confocale Spinning Disk
- Savoir-faire opérationnel en microscopie à feuille de lumière structurée et microscopie confocale Spinning Disk
- Maîtrise de l'outil informatique et des logiciels de traitement et analyse d'images tels que ImageJ, Imaris
- Bio informatique et programmation avec logiciels scientifiques (R, Matlab, Python)
- Métrologie
- Capacité à communiquer en français et en anglais (niveau B2) avec des publics variés (étudiants, ITA, chercheurs, privés, commerciaux)
- Savoir coordonner différents projets en parallèle
- Gérer les relations avec les interlocuteurs de la plateforme
- Savoir rédiger des rapports, notes techniques, publications
- Savoir valoriser des résultats, effectuer des présentations
- Connaissance des réglementations du domaine en hygiène et sécurité
- Capacité à travailler en équipe, dynamisme, autonomie
- Goût du contact et de l'échange avec les utilisateurs du plateau technique
Contexte de travail
L'ingénieur sera en poste sur le plateau d'imagerie NSB3 de la plateforme régionale CEMIPAI, sur le campus CNRS route de Mende. Le plateau compte actuellement 5 microscopes dédiés au vivant, dont 1 microscope dédié à la microscopie super-resolution PALM/STORM, 1 confocal automatisé, 1 spinning disk et 1 microscope STED couplé à un Bio-AFM. Un microscope à feuille de lumière structurée LLSM rejoindra ce parc d'instruments en Janvier 2026. Installés dans les 230m2 du laboratoire confiné de classe 3 de la plateforme CEMIPAI, ces instruments constituent un plateau pionnier de l'imagerie de modèles vivants infectés/infectieux unique en France. La plateforme CEMIPAI est labellisée Gis Ibisa. La description détaillée des équipements est accessible sur le site web : cemipai.cnrs.fr. La personne recrutée travaillera sous la direction du responsable du plateau et du directeur de la plateforme.
La plateforme CEMIPAI est une unité d'appui à la recherche mixte CNRS/Université de Montpellier, centrée sur l'infectiologie et la pharmacologie anti-infectieuse. Elle est composée de 7 personnels ITA (dont 2 en CDD). CEMIPAI met à la disposition des équipes de recherche l'un des plus vastes laboratoires confinés de niveau NSB3 de France. Il est organisé en huit modules indépendants entièrement équipés pour tout type d'expériences in vitro sur virus et microorganismes hautement pathogènes de classe 3. Les services de la plateforme et la location d'espaces NSB3 sont accessibles aux laboratoires publics et aux PME. CEMIPAI propose par ailleurs des services de criblage à la carte pour la recherche de molécules antivirales, sous la forme de prestations de service, de collaborations ou de projets de recherche. Les expériences sont menées dans les installations de la plateforme par une équipe d'ingénieurs spécialisés dans la manipulation d'agents infectieux de classe 3. Le plateau de microscopie NSB3 complète ce dispositif.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
L'ingénieur sera en poste sur le plateau d'imagerie NSB3 de la plateforme régionale CEMIPAI, sur le campus CNRS route de Mende. Le plateau compte actuellement 5 microscopes dédiés au vivant, dont 1 microscope dédié à la microscopie super-resolution PALM/STORM, 1 confocal automatisé, 1 spinning disk et 1 microscope STED couplé à un Bio-AFM. Un microscope à feuille de lumière structurée LLSM rejoindra ce parc d'instruments en Janvier 2026. Installés dans les 230m2 du laboratoire confiné de classe 3 de la plateforme CEMIPAI, ces instruments constituent un plateau pionnier de l'imagerie de modèles vivants infectés/infectieux unique en France. La plateforme CEMIPAI est labellisée Gis Ibisa. La description détaillée des équipements est accessible sur le site web : cemipai.cnrs.fr. La personne recrutée travaillera sous la direction du responsable du plateau et du directeur de la plateforme.
La plateforme CEMIPAI est une unité d'appui à la recherche mixte CNRS/Université de Montpellier, centrée sur l'infectiologie et la pharmacologie anti-infectieuse. Elle est composée de 7 personnels ITA (dont 2 en CDD). CEMIPAI met à la disposition des équipes de recherche l'un des plus vastes laboratoires confinés de niveau NSB3 de France. Il est organisé en huit modules indépendants entièrement équipés pour tout type d'expériences in vitro sur virus et microorganismes hautement pathogènes de classe 3. Les services de la plateforme et la location d'espaces NSB3 sont accessibles aux laboratoires publics et aux PME. CEMIPAI propose par ailleurs des services de criblage à la carte pour la recherche de molécules antivirales, sous la forme de prestations de service, de collaborations ou de projets de recherche. Les expériences sont menées dans les installations de la plateforme par une équipe d'ingénieurs spécialisés dans la manipulation d'agents infectieux de classe 3. Le plateau de microscopie NSB3 complète ce dispositif.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Zone ZRR/Laboratoire L3.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Zone ZRR/Laboratoire L3.
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