Vos missions en quelques mots Missions : L'agent réalisera la gestion et le traitement des données -omiques issues des équipes de recherches en science du vivant pour les unités de l'Institut de Biologie Physico-Chimique Activités : - Analyser des données de séquençage haut-débit en génomique et transcriptomique (Illumina et Nanopore) - Réaliser des analyses fonctionnelles, différentielles et statistiques sur de larges jeux de données (tests, modélisation et clustering) - Assurer la traçabilité et la reproductibilité et la reproductibilité des analyses - Diffuser un savoir-faire en bioinformatique et accompagner les équipes de recherche souhaitant effectuer leurs analyses de données haut-débit - Aider les demandeurs à formaliser leur demande d'analyses en bioinformatique et statistique - Contribuer à la veille scientifique afin de maintenir l'expertise indispensable dans le domaine de l'analyse bioinformatique de données omiques dans un contexte de rapide évolution des technologies de séquençage Contexte de travail : L’Institut de Biologie Physico-Chimique (IBPC), situé au cœur de Paris représente l'un des principaux centres de recherche fondamentale en biologie en région parisienne. Il aborde de façon résolument multidisciplinaire les bases structurales, génétiques et physico-chimiques du vivant, étudiées à leurs différents niveaux d'intégration, de la molécule à l'organisme. Il regroupe environ 180 personnes au sein de cinq unités de recherche travaillant principalement sur la biologie des micro-organismes procaryotes ou eucaryotes. L’étude de la physiologie et de l’expression génétique de ces organismes comporte des approches de génomique fonctionnelle. La personne recrutée travaillera dans la gestion et le traitement des données obtenues et contribuera à la formation des nouveaux arrivants. L’encadrement scientifique sera assuré par Alexandre Maes (IR de l’UMR8226), responsable scientifique de la plateforme de génomique fonctionnelle. Il aidera à coordonner son travail et assurera une expertise scientifique sur les projets de recherche pris en charge par l'ingénieur d'études plateforme au service de toutes les unités. Profil recherché Competences : Savoirs et connaissances : - Titulaire d'un master ou d'un doctorat en bio-informatique - Formation initiale en bio(informatique) et statistique avec un fort intérêt pour les applications biologiques, notamment dans les domaines de la génomique fonctionnelle - Bonnes connaissances en biologie - Expertise dans l'analyse statistique d'ensembles de données omiques et la construction de workflows Savoir-faire : - Maitrise de la programmation Python et de l'environnement Linux - Maitrise des logiciels utilisées pour l'analyse de données génomiques, RNA-Seq et ChiP-Seq - Expérience réussie en bio-informatique appliquée aux données génomiques et transcriptomiques Savoir-être : - Bonne communication avec les équipes de recherche - Ouverture d'esprit - Intérêt pour les questions biologiques - Travail en équipe - Autonomie - Capacité d'écoute - Force de proposition Contraintes et risques : Quotité de travail : 38,5 heures par semaine Télétravail possible Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français Seuil
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