Ingénieur d’études en bioinformatique génomique et multi-omics (f/h)

Ingénieur d’études en bioinformatique génomique et multi-omics (F/H)

L’équipe de recherche s’intéresse aux mécanismes moléculaires et cellulaires des épilepsies avec malformations corticales causées par des mutations somatiques (PMID: 38710875, PMID: 36635388, PMID: 31444548). Il s’agit d’une équipe multidisciplinaire alliant la bio-informatique, la génétique, et l’établissement de modèles de la maladie in vitro et in vivo.

Objectif principal du projet : Élucider les bases moléculaires et cellulaires des malformations corticales associées à l'épilepsie.

Méthodologie :

* Détection de variants somatiques à partir de données de séquençage de l'exome (WES) et du génome (WGS) sur tissus
* Analyse bioinformatique de données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale

MISSIONS PRINCIPALES

En tant qu'ingénieur(e) de recherche, vous serez chargé(e) de:
* Réaliser le calling des variants somatiques sur des données de génomes en short et long reads
* Analyser la distribution de la fréquence allélique des variants (VAF) et effectuer du lignage cellulaire (lineage tracing)
* Analyser les données de séquençage d'ARN en cellule unique (scRNA-seq) et de transcriptomique spatiale
* Intégrer les différents types de données (génomiques et transcriptomiques)
* Présenter les résultats lors des réunions d'équipe et des congrès scientifiques
* Participer à la rédaction de rapports scientifiques et de publications
1. Master en bioinformatique (avec expérience) ou PhD en bioinformatique/génomique
2. Solide expérience en bioinformatique génomique
* Master en bioinformatique (avec expérience) ou PhD en bioinformatique/génomique
* Solide expérience en bioinformatique génomique
Savoir-faire
* Maîtrise des langages de programmation pertinents (ex : Python, R)
* Expérience dans l'analyse de données de séquençage à haut débit (WGS, RNA-seq)
* Connaissance des approches d'analyse en cellule unique et de transcriptomique spatiale.
* Maîtrise de l'anglais scientifique (oral et écrit).

Savoir-être
* Capacité à travailler de manière autonome et organisée
* Faire preuve d’une rigueur scientifique
* Aisance relationnelle et à interagir avec les membres de l’équipe
* Curiosité scientifique et capacité d'adaptation à de nouvelles technologies

L’Institut du cerveau s’engage pour lutter contre toute forme de discrimination. Nous garantissons un environnement de travail inclusif et respectueux de toutes les diversités.

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Institut du Cerveau
Hôpital de la Pitié-Salpêtrière
47, boulevard de l'Hôpital
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