Vos missions en quelques mots Missions : Le CRBE Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’environnement, est une unité mixte de recherche (UMR5300) dont les thématiques scientifiques s’articulent autour de l’influence des changements environnementaux et de leurs interactions avec la terre vivante, et les rétroactions des systèmes socio-écologiques sur ces changements. La personne travaillera en collaboration avec Philipp Heeb & Joël White en collaboration avec une thésarde et aura pour mission d’analyser des données de séquençage issues de projets pluriannuels et à large échelle afin d’examiner les facteurs écologiques et phénotypiques qui façonnent le microbiote intestinal des oiseaux. Elle effectuera en outre un travail d’analyses moléculaires et de traitement bioinformatique sur des données de metabarcoding alimentaire (projet ANR Copa-Co) Activités : - Analyses statistiques et approches multivariées sur données de metabarcoding 16S - Rédaction d’articles scientifiques et communications - Analyses en biologie moléculaire (Extraction, PCR, préparation de librairies et séquençage) sur ADN fécal et optimisation des protocoles - Traitement bioinformatique des données de metabarcoding alimentaire Contexte de travail : Nos recherches visent à mieux comprendre le rôle du microbiote intestinal dans la réponse des organismes face aux perturbations anthropiques de leur environnement. Nous explorons en particulier l’impact de l’urbanisation sur les interactions hôte-microbiote chez les mésanges. Télétravail possible sur une journée flottante par semaine sous condition de l’autonomie de l’agent et de la déclaration via les outils de la tutelle Profil recherché Competences : - Compétences en sequençage en approche par metabarcoding - Compétences en bioinformatique - Compétences en analyses statistiques multivariées - Compétences rédactionnelles et valorisation des données - Maitrise des techniques de biologie moléculaire - Proactivité, autonomie et rigueur - Capacité à travailler en équipe Contraintes et risques : Le travail consistera principalement à réaliser des analyses en bioinformatique au sein des ressources informatiques et plateforme B2M du CRBE. La possibilité de participer au travail de terrain sera examinée au cours du contrat. Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français Seuil
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