Le post-doctorant contribuera à l'étude des génomes de Saccharomyces en se concentrant sur l'étude des régions télomériques à l'aide du séquençage « long-read ». Cela comprend l'analyse de souches naturelles, modifiées et de cellules réplicatives âgées. Le post-doctorant étudiera l'impact du phénotype de la longueur des télomères et son rôle dans la régulation du paysage de la fitness des espèces. Le post-doctorant collaborera également à d'autres projets actuellement en cours au sein du groupe (https://ircan.org/en/research/gianni-liti).
Activités
Le post-doctorant réalisera à la fois des expériences et des analyses informatiques afin de caractériser les variations de longueur des télomères :
Tâches principales :
- Édition du génome de la levure
- Phénotypage de la levure
- Séquençage du génome de la levure à l'aide de la technologie de lecture longue
- Analyse des données
Compétences
Une expérience préalable en biologie moléculaire et en génomique est indispensable.
Des connaissances approfondies en biologie des télomères, en biologie du vieillissement et en analyse génomique par séquençage de nouvelle génération sont également indispensables, ainsi que de solides connaissances en statistiques.
Contexte de travail
Le post-doctorant sera affecté à l'équipe du Dr Gianni LITI « Génomique des populations et traits complexes ». Cette équipe est l'une des équipes fondatrices de l'IRCAN et est située à la Faculté de médecine de Nice. Elle dispose de tout l'équipement nécessaire pour mener des expériences en génétique et génomique de la levure et a accès à des installations de pointe en microscopie, cytométrie et génomique, ainsi qu'à des serveurs informatiques et de stockage.
Contraintes et risques
Le système avec lequel nous travaillons (la levure) est connu pour être sûr et non pathogène. Certains des produits chimiques utilisés dans les expériences sont toxiques et doivent être manipulés conformément aux instructions. Une initiation à la sécurité sera dispensée avant le début des activités expérimentales.
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