Bioinformaticien·ne h/f

Vous serez accueilli-e au sein de l'Unite mixte de recherche (UMR) INRAE-CIRAD ASTRE qui comprend plus de 100 agents permanents et se structure en différentes entités dont un « Collectif Vecteurs » comprenant 13 agents. Ceux-ci travaillent dans les différents sites de l'UMR dont une majorité à Montpellier sur des thématiques ou modèles d'entomologie médicale et vétérinaire, prioritaires pour le Sud et à risque pour le Nord : Culicoides, moustiques, tiques et glossines. L'UMR ASTRE est basée sur le campus de Baillarguet à Montpellier dans un environnement scientifique performant avec 500 scientifiques sur le campus et des locaux et plateformes de qualité.
L'objectif de l'UMR ASTRE est d'améliorer la santé animale, la santé publique et la sécurité alimentaire au Sud notamment dans le cadre des changements globaux et des transitions des socio-écosystèmes. L'enjeu majeur est de développer une approche intégrative de la santé. Les maladies à transmission vectorielle constituent une thématique prioritaire pour l'UMR ASTRE dans le cadre des changements globaux et des émergences. Outre ces activités de recherche, le Collectif Vecteurs a pour mission de répondre à des sollicitations à la fois intra-unité ou extérieures, tels des besoins d'expertise, d'analyse ou de diagnostic. Le Collectif Vecteurs développe des recherches sur la caractérisation des interactions hôte-vecteur-microbiote pour mieux comprendre l'épidémiologie de maladies prioritaires. Ces études sur la dynamique et l'expansion de populations invasives, la compétence vectorielle et les agents pathogènes et le microbiome portés par les arthropodes font appel à des approches de génomique, de génomique des populations, de métagénomique et de métabarcoding. Les modèles d'arthropodes cibles sont les tiques dures, les tiques molles, les culicoïdes et les moustiques d'intérêt vétérinaire/zoonotique en Méditerranée-Europe et dans les zones tropicales.
Vous travaillerez en étroite interactions avec les deux bioinformaticiens de l'unité.
Vous serez basé-e au Cirad sur le Campus de Baillarguet à Montpellier et vous participerez aux activités de recherche, d'expertise, de formation développées et coordonnées par le Collectif Vecteur de l'UMR ASTRE. Vos activités principales seront :
- Aider à la conception et organisation de la collecte et le traitement de données issues de la recherche en sciences du vivant au sein de l'unité ;
- Analyser et aider à la résolution des problèmes bio-informatiques et/ou de traitement de données dans le cadre des projets et programmes de recherche de l'unité, si nécessaire à travers de la conception, développement et déploiement des outils de traitement automatisés ;
- Conseiller sur le choix de méthodologies lors de l'élaboration d'un projet scientifique et dans leur mise en oeuvre, et contribuer à la rédaction des protocoles d'utilisation des outils, des méthodes mises en place, ainsi que des sections spécialisées des articles ou de demandes de financement ;