Ingénieur-e en techniques biologiques h/f

Informations générales

Réservé aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI) et aux fonctionnaires et CDI de droit public
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e en techniques biologiques H/F
Référence : UMR7238-MOBINT-O53022
Lieu de travail : PARIS CEDEX 06
Institut : INSB - Institut des sciences biologiques
Date de publication : lundi 5 mai 2025
Session : Campagne Printemps 2025
Groupe de Fonction : IEG3
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e en techniques biologiques

Missions

La personne recrutée accompagnera l'arrivée dans le Laboratoire de Biologie Computationnelle
et Quantitative {CQSB, UMR 7238) de deux nouvelles équipes, l'équipe FIONA (Functional Imaging Of
Nuclear Architecture) dirigée par Judith Miné-Hattab et l'équipe HEAL (Horizontal Evolution of
Eukaryotic ALgae) dirigée par Richard Dorrell. Ces deux équipes, bien que travaillant sur des
systèmes différents, sont réunies par l'utilisation des approches de la biologie moléculaire et de
la microscopie pour comprendre la biologie fondamentale de la diversité des micro-organismes
eucaryotiques.
Judith Miné-Hattrab (CRCN, CNRS), qui développe de nouvelles thématiques de recherche expérimentales
interdisciplinaires (biologie, physique, mathématiques) a rejoint le LCQB en 2022 pour monter une
nouvelle équipe avec l'aide d'un financement ATIP. Cette équipe se compose d'un PI, de 2
postdoctorants
et de 3 étudiants en thèse (arrivée en septembre 2023).
Richard Dorrell (CRCN, CNRS) a rejoint le LCQB en janvier 2024 pour créer une nouvelle équipe avec
l'aide d'une ERC Starting Grant. L'équipe du Dr Dorrell étudie le fonctionnement et la signification
éco-évolutive des transferts horizontaux de gènes entre des algues éucaryotiques tels que
dinoflagéllées, haptophytes et diatomées, dans des écosystèmes menacés par du changement climatique
co=e l'Océan Arctique. Son équipe se compose d'un PI, un post-doctorant, 1 étudiant en thèse, et
une assistante ingénieure en CDD.
Les activités des deux équipes génèrent de nombreuses ressources biologiques (collections de
plasmides, de souches de levure, d'algues marins et cryophiles et de lignée humaines) nécessitant
une gestion et un entretien régulier. La/le IE effectuera des taches co=unes aux 2 équipes et
favorisera le développement de projets transversaux entre les 2 équipes.

Activités

Le/ la candidate gérera le fonctionnement quotidien des équipes FIONA et HEAL, avec une répartition
du temps 60/ 40 entre les deux groupes.
Le/ la candidate sera chargé.e des tâches suivantes :
- Assurer la formation des nouveaux arrivants aux règles et techniques de laboratoire
- Gérer les bases de données d'échantillons biologiques (souches de micro-organismes, de
plasmides, d'amorces ADN, de bactéries, de levures et lignée de cellules humaines)
- Gérer les stocks et les commandes de réactifs (milieux de culture, réactifs chimiques).
- Superviser l'application des règles d'hygiène et de sécurité
- Assurer l'entretien et la maintenance de premier niveau du matériel
- Organiser et gérer les relations avec les fournisseurs
IL/elle pourra être aidé.e par des ITA embauchés en CDD par les deux équipes.
De plus, le/ la candidate sera chargé.e du développement de projets transversaux entre les deux
groupes. Un premier projet sera l'expression d'une protéine nouvelle d'algues marines, impliquée
dans le transport des métabolites chloroplastiques, en levure.
Des futurs projets entre les deux équipes pourraient inclure entre autres :
- Mise au point de protocoles pour la microscopie super résolution sur différents organismes
utilisés par l'équipe REAL.
- Caractérisation de lignées humaines génétiquement modifiée.
- Mise au point de protocoles pour cultiver des sphéroïdes de cellules humaines.
Welle sera améné.e à créer des plateformes et outils (inventaires de stocks ... ) co=uns entre les
deux équipes, et organisera des réunions hebdomadaires pour renforcer les liens techniques et
conceptuels entre les deux groupes.

Compétences

- Biologie moléculaire : PCR, clonage de plasmides, construction de souches de levure, cripserCas9,
séquençage, extraction d'ARN et ADN.
- Western Blot, caractérisation de lignée de cellules.
- Microbiologie : mise en culture stérile des organismes eucaryotes. Une connaissance
préalable de la culture d'algues et de la culture en L2 serait préférée mais pas essentielle.
- Informatique : utilisation de Windows office. Une expérience préalable dans l'utilisation
d'outils de gestion du laboratoire (Geslab ... ) serait préférable.
- Administration d'un groupe de recherche : expérience dans la gestion des stocks, obtention
des devis, négociation et suivi des contrats de maintenance.
- Niveau d'anglais suffisant pour travailler avec des collègues ou utilisateurs non
francophones (Niveau Bl cadre européen commun de référence pour les langues)

Contexte de travail

La nouvelle équipe FIONA étudie les changements d'organisation et de dynamique nucléaire en réponse
au stress tel que la compression cellulaire (projet ATIP) ou les dommages de l'ADN. Pour cela,
l'équipe utilise et développe des approches de microscopie de super-résolution, combinées à des
outils de micro-fluidique et de modélisation. Grace à l'implémentation de différents modules de
microscopie l'équipe met en place des techniques de microscopie de pointe unique sur le plan
international. Ces techniques, ainsi que les méthodes d'analyse correspondantes, sont mises à la
disposition de la plateforme CIF de l'IBPS (Cellular Imagery Facilility) et des équipes de l'IBPS
souhaitant utiliser la microscopie super résolution.
La nouvelle équipe HEAL étudie l'histoire évolutive et biologie cellulaire et environnementale
d'algues marins, avec une forte emphase sur des lignées originaires des endosymbioses secondaires
(haptophytes, dinoflagéllées, diatomées), et des écosystèmes fragilisés par l'activité
anthropogénique (l'Océan Arctique). L'équipe maîtrise en particulier l'utilisation des techniques
informatiques (phylogénie, modélisation environnementale) pour comprendre les innovations évolutives
qui expliquent la biologie des algues modernes, et l'application de la biologie moléculaire aux
algues transformables (la diatomée Phaeodactylum) pour préciser les phénotypes des protéines
nouvelles et méconnues dans ces groupes. Les futurs projets de l'équipe HEAL viseront intégrer
l'algue verte Chlamydomonas, déjà utilisé au CQSB, dans ce projets, ainsi que de développer des
nouvelles modèles expérimentales pour des groupes d'algues importants dans l'écosystème marin, avec
un fort intérêt dans les impacts du réchauffement global de l'océan sur sa présente et future
biodiversité.