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Ingénieur d'études en biologie (f/h)

Montpellier
UNIVERSITE DE MONTPELLIER - BIATSS
Ingénieur d'études
Publiée le 21 octobre
Description de l'offre

À propos de nous

Une université d’excellence

Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).

Une université engagée

Vigilante envers toutes formes de discriminations, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. Elle est attachée aux fondements du service public, à la laïcité, à l’égalité des chances et à l’accès de tous aux savoirs. Elle promeut les valeurs académiques telles que l’éthique, l’intégrité scientifique et la liberté universitaire. L’UM place enfin le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.
Dans le cadre de ses engagements, l’université promeut le CV sans photographie.

Structure de rattachement : Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier (CRBM)


Mission

Intitulé du projet : Étude de l'interaction entre les infections par Coxiella burnetii et les dommages à l'ADN

Acronyme du projet : PATHAFIX

Durée globale du projet : 42 mois

Description sommaire du projet : Le sélénium est un oligo-nutriment essentiel à la vie grâce aux acides aminés séléniés comme la sélénocystéine que l’on trouve principalement dans les produits marins. Le développement d’une aquaculture durable pousse à la valorisation des co-produits de poisson comme source de Se, mais ils peuvent néanmoins contenir des contaminants métalliques tels que le mercure (Hg), un des polluants les plus dangereux. Pour évaluer le potentiel de ces aliments aquacoles alternatifs, le projet MOONFISH vise à élucider le métabolisme du Se et l’impact du Hg chez des alevins de truite arc-en-ciel notamment par spectrométrie de masse MALDI-TOF. Dans ce contexte, notre objectif consiste à mettre au point des dérivés organophosphorés π-conjugués comme nouvelle classe de matrices MALDI, sur la base de synthèses décrites au laboratoire. Cela permettrait d’améliorer la détection des espèces de Hg avec une meilleure résolution et une meilleure sensibilité et de mieux comprendre ses interactions avec les biomolécules.

Mission principale : Étudier l'interaction entre la DDR et les infections bactériennes en utilisant Coxiella comme modèle : 1) déterminer si les dommages observés à l'ADN sont causés par l'infection ou s'il s'agit d'une stratégie défensive des cellules infectées ; définir le type de dommages à l'ADN ; identifier le chemin moléculaire menant à leur apparition. 2) évaluer si et comment Coxiella (et, en particulier, son effecteur CBU1636) manipule le DDR de l'hôte et/ou déclenche son pouvoir de réparation de l'ADN.

Définition des tâches à accomplir :

1) Caractériser les dommages à l’ADN provoqués lors de l’infection par Coxiella burnetii (ADN simple brin ?, cassures double brin de l'ADN ?), à l'aide de techniques telles que le western blot, la microscopie, l'électrophorèse en champ pulsé, les tests comète natif et alcalin sur ADN, et le peignage moléculaire de l'ADN.

2) Comprendre comment le CBU1636 stimule l'activité de l'ATR :

a) de manière canonique : nous explorerons la possibilité que la protéine CBU1636 stimule le rôle de la kinase ATR dans la réponse aux dommages à l'ADN (par exemple en améliorant son interaction avec son effecteur NEK1, la liaison d’ATR à l'ADN, son activité kinase et/ou la phosphorylation de ses effecteurs en aval. Nous utiliserons des inhibiteurs de l'ATR et des veresions soit WT de CBU1636, soit des versions mutantes.

b) de manière atypique, nous explorerons si CBU1636 module un aspect non canonique de la biologie de l'ATR qui concerne les membranes cellulaires, en évaluant par microscopie et par fractionnement biochimique si ATR est relocalisé vers la membrane nucléaire interne pendant l'infection, ou lors de la surexpression de VICE, ce qui imite les altérations membranaires créées par l'infection ; la localisation de GFP-CBU1636 en réponse à des altérations de membrane, si le site de phosphorylation sur ATR Thr-1989 participe à l'engagement membranaire, si le mutant phospho-mort ATR-Thr1989Ala est insensible à l'action de CBU1636 ; si CCTα, l'enzyme limitant de la voie de synthèse de la phosphatidylcholine, se déplace vers l'enveloppe nucléaire lors de l'infection, et si une interaction tripartite CBU1636-ATR-CCTα se produit dans ces circonstances.

Description précise de l'évènement ou du résultat objectif déterminant la fin de la relation contractuelle ainsi que les modalités d'évaluation et de contrôle de ce résultat : Les tâches décrites plus haut devront avoir été soit exécutées, soit éventuellement rejetées car plus d’actualité (si une hypothèse est à rejeter) ou pas viables après tentative expérimentale adéquate. Ainsi, ce n’est donc pas l’obtention du résultat biologique qui détermine la fin de la relation contractuelle, mais la preuve vérifiable que la mise en œuvre expérimentale a bien eu lieu. Ceci est mesurable en consultant le cahier électronique de laboratoire (eLAB).


Profil

Qualifications / Domaine de formation demandé :

L'agent sera responsable de manipuler de lignées cellulaires par transfection, silencement, caractérisation des interactions entre protéines, entre lipides ((co-)immunoprecipitation, proximity ligation assay), purifications des membranes, création des mutations en plasmides et dans le génome, Western Blot, immunofluorescence, cytométrie, analyse de prolifération cellulaire et du métabolisme de I'ADN par des techniques telles que le Pulsed Field Gel Electrophoresis, Comet Assay, DNA Combing Assay, dot blot, SMART, l'extraction d'ADN et ARN, la rétrotranscription et la qPCR. De plus, il faudra préparer et traiter des échantillons pour la microscopie à fluorescence et électronique, rédaction des protocoles, des résultats, rédaction des méthodes utilisées en forme de papier scientifique, présentation des données aux collègues, analyse d'images, et de préférences programmations de macros pour quantification (semi)automatique d'images acquises. La personne sera responsable de la gestion d'une partie des stocks du labo, commandes pour l'équipe, et exercera des fonctions dans I ‘organisation de la salle de culture. Il est donc attendu des connaissances approfondies de biologie moléculaire, cellulaire, microscopie et biochimie. Anglais courant, autonomie de travail à la paillasse et intellectuelle, savoir s'intégrer dans une équipe et interagir avec d'autres équipes, car projet dans le cadre d’une collaboration.



Rejoindre l'université de Montpellier, c'est bénéficier de nombreux avantages dans une région qui offre un cadre de vie qualitatif.

Nos avantages :
> Dispositifs de développement des compétences : accès à une grande offre de formation, préparation aux concours internes
> Jusqu’à 46 jours de congés / an (pour un temps plein à 38h30)
> Temps de travail aménageable
> Jusqu'à 2 jours de télétravail / semaine (selon les modalités de la charte de TT applicable à l'UM)
> Restauration collective
> Aide et prestations sociales
> Prise en charge partielle des abonnements au transport de la ville
> Accès aux activités sportives, culturelles et de loisirs de l'université
> Soutien à la parentalité : club de loisirs pour enfant, partenariat de crèches, jours enfant-malade
Avantages dépendant de la nature et la durée du contrat, des nécessités de services et des conditions d'éligibilité


Informations complémentaires :

Rémunération : de 2160€ à 2325€ bruts mensuels, dont 200€ d'indemnité mensuelle des agents contractuels (prime)

Prise de poste : Janvier

Type de contrat : CDD de catégorie A

Durée du contrat : 3 ans

Clôture des candidatures : 21/11/2025

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