Ingénieur de recherche en analyse d'images médicales h/f

A propos d'Inria

Inria est l'institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l'interface d'autres disciplines. L'institut fait appel à de nombreux talents dans plus d'une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d'appui à la recherche et à l'innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'eorce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie. Ingénieur de recherche en analyse d'images médicales

Type de contrat : CDD

Niveau de diplôme exigé : Thèse ou équivalent

Fonction : Ingénieur scientifique contractuel

Niveau d'expérience souhaité : Jeune diplômé

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

L'Inria est l'Institut national de recherche en sciences du numérique, dont le centre Inria d'Université Côte d'Azur fait partie. Avec une forte expertise en informatique et mathématiques appliquées, les projets de recherche du centre Inria d'Université Côte d'Azur touchent toutes les dimensions des sciences et technologies du numérique, et génèrent de l'innovation. Implanté principalement à Sophia Antipolis, mais également à Nice ou Montpellier, il regroupe 47 équipes de recherche et neuf services d'appui. Il est présent dans les domaines de l'intelligence artificielle, la science des données, la sécurité des systèmes informatiques, la robotique, l'ingénierie de réseaux, la prévention des risques naturels, la transition écologique, la biologie numérique, les neurosciences computationnelles, les données de santé Le Centre Inria d'Université Côte d'Azur est un acteur majeur en termes d'excellence scientifique par les résultats obtenus et les collaborations tant au niveau européen qu'international.

Contexte et atouts du poste

L'ingénieur sera recruté par l'Institut de Biologie de Valrose, un institut de recherche de l'Université Côte d'Azur.

Le travail s'effectuera au sein de l'équipe projet Epione du Centre Inria d'Université Côte d'Azur à Sophia-Antipolis, en collaboration trèsétroite avec l'Institut Universitaire Locomoteur et du Sport et le service de chirurgie orthopédique du CHU de Nice.

Le poste s'inscrit dans le cadre du projet de Recherche Hospitalo-Universitaire (RHU) ReBone, qui vise à améliorer la prise en charge des patients présentant des fractures osseuses complexes.

L'ingénieur de recherche aura pour responsabilité principale le développement d'outils innovants destinés à automatiser la segmentation de l'anatomie osseuse et l'étiquetage des fragments osseux.

Mission confiée

La planification de la réduction chirurgicale des fractures osseuses est fondamentale en orthopédie et en traumatologie. Dans le cas des fractures complexes touchant les régions du poignet, du genou, et du bassin, l'enjeu pour le système de santé national est particulièrement important, car ces traumatismes sont d'une fréquence élevée, ont un impact considérable sur la qualité de vie des patients, et demandent un haut niveau d'expertise de la part du chirurgien.

C'est pour cette raison que le projet de Recherche Hospitalo-Universitaire (RHU) ReBone, une initiative de recherche collaborative d'ampleur nationale, vise à améliorer la prise en charge des patients victimes des fractures osseuses complexes du radius distale, du plateau tibial, et de la cotyle du bassin. Ce projet implique des chirurgiens ainsi que des chercheurs en science des données, des matériaux, et en imagerie biomédicale issus de différents partenaires publics et privés français. Parmi les objectifs de ce projet figure la création d'algorithmes automatisés pour la segmentation et la réduction des fragments osseux détectés à l'aide de l'imagerie scanner ainsi que la création de bases de données annotées servant de référence.

L'ingénieur de recherche aura pour responsabilité principale le développement d'outils innovants destinés à automatiser la segmentation de l'anatomie osseuse et l'étiquetage des fragments osseux chez les patients présentant des fractures complexes. Il contribuera également à la mise en place et à la conduite d'un processus d'annotation collaborative en lien étroit avec des chirurgiens orthopédistes.

De manière concrète, ses missions comprendront :

- La conception et documentationen françaisd'un outil de segmentation de structures osseuses fracturées pouvant être déployé au sein d'un service de traumatologie.
- La segmentation d'image automatisée de l'anatomie osseuse ainsi que des différents fragments osseux dans les images tomodensitométriques utilisant l'intelligence artificielle générative.
- Le développement d'outils interactifs de correction en trois dimensions de la segmentation d'images
- La génération de cartes de segmentation "vérité-terrain" à l'aide des outils précédents en collaboration étroite avec des chirurgiens orthopédistes.
- La bonne intégration de ces développements au sein du projet RHU ReBone.

Principales activités

Principales activités :

- la conception, l'entraînement et l'optimisation d'algorithmes de segmentation d'images scanner s'appuyant sur les approches les plus récentes en intelligence artificielle générative,
- le développement d'outils interactifs en trois dimensions pour la correction des cartes de segmentation produites par ces algorithmes,
- l'intégration de ces développements dans le cadre du projet RHU ReBone, en assurant une documentation complète et en français des outils créés.

Activités complémentaires (3 maximum) :

- Communication sur les développements réalisés
- Documentation de l'avancement du projet
- Rédaction de documents pour la conformité réglementaire

Compétences

Compétences techniques et niveau requis :

- Expérience dans le traitement des images médicales
- Expérience en développement Python
- Expérience en techniques d'apprentissage profond

Des connaissances sur des outils d'annotation interactive sont considérés comme un plus.

Langues :

- Français écrit et parlé

Avantages

- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des oeuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Participation mutuelle (sous conditions)

Rémunération

A partir de 2692 € brut mensuel (selon diplôme et expérience)