Description
Ce stage s’inscrit dans le cadre du projet ANR SUBLIM, coordonné par l’ANSES et dont l’objectif est d’identifier des paramètres biologiques et environnementaux permettant de prédire le risque de contamination des surfaces par monocytogenes dans les industries agroalimentaires. Une campagne de prélèvements a été menée dans 9 usines de production et plus de échantillons ont été analysés. Un traitement statistiques approfondi des données a permis d’identifier des facteurs ou combinaisons de facteurs associés à la présence de Listeria, dont certains ont déjà été explorés au laboratoire. Ce stage sera effectué en collaboration étroite avec les partenaires du projet (ANSES, INRAe, IUT de Saint-Brieuc, IFIP) et aura pour objectif d’étudier l’impact du microbiote surfacique, des gènes de résistance aux antimicrobiens, ou encore des conditions physico-chimiques, sur la capacité de Listeria monocytogenes à adhérer aux surfaces, à former des biofilms et à survivre aux traitements désinfectants ou aux stress subis dans les ateliers agroalimentaires.
Dans ce contexte, le/la stagiaire sera amené à :
1. Mettre en place des modèles de biofilms de L. monocytogenes dans différentes conditions représentatives des environnements industriels (présence d’une flore bactérienne annexe, de résidus de biocides, application d’un traitement désinfectant)
2. Réaliser des extractions d’ARN et des analyses d’expression génique (RTqPCR) ciblant des gènes d’intérêt impliqués dans la résistance de Listeria
Des compétences théoriques et pratiques en microbiologie et en biologie moléculaire (extractions d’ARN, RT-qPCR) sont souhaitées.
Profile
3. Etudiant en Master 2
4. Des compétences théoriques et pratiques en microbiologie et biologie moléculaire (RT-qPCR)
5. Compétences avérées en rédaction
Starting date
Dès que possible
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