Mission :
L'équipe étudie la régulation des Eléments Transposables (séquences répétées d'ADN potentiellement mobiles et/ou régulatrices) et des éléments mobiles chez la plante modèle Arabidopsis : les bases moléculaires de leur activation en réponse à des stress biotiques et les mécanismes épigénétiques qui peuvent les contrôler négativement.
La mission consiste à disséquer la régulation d'éléments transposables et éléments mobiles (T-DNA) durant l'interaction Arabidopsis-Agrobacterium en mettant en œuvre différentes méthodologies en lien avec l'analyse de la chromatine, de l'ARN et des protéines afin de finaliser une étude en cours. De plus, la mission consiste aussi à servir de soutien ad hoc à différents projets du laboratoire.
Activités :
• Activité 1 : Mise en œuvre de méthodologies pour l'étude de la régulation d'éléments transposable durant l'interaction Arabidopsis-Agrobacterium : Culture de plantes in vitro – infection par Agrobacterium – coloration GUS – western blot – extraction d'ARN et RT-qPCR – clonage – exploration et visualisation de données de séquençage ONT long-read disponibles sur Integrative Genome Browser (IGV)
Activité 2 : Apporter un soutien technique ad hoc aux projets de recherche développés dans l'équipe : génotypage –obtention et collecte du matériel biologique quand nécessaire- aide à immunoprécipitation de la chromatine
Activité 3 : Interagir avec les services de soutien et support (magasin, serres) de l'I2BC-participation aux commandes, au maintien de la base de données, à la gestion des stocks
Activité 4 : Présentation et communication des résultats en réunion d'équipe et séminaire de département
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