Ingénieur en expérimentation et instrumentation biologiques (réf. bfasu2) f/h

Fonctions : Ingénieur en expérimentation et instrumentation biologiques

Emploi-type : A2A42 – Ingénieur en analyses métabolomiques et protéomiques par spectrométrie de masse

Catégorie : A

Corps : Ingénieur d’études

BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l’environnement

CDD de 1 an, renouvelable



Mission : Développer, adapter et mettre en œuvre des approches métabolomiques et protéomiques par spectrométrie de masse.



Activités principales :

* Conseiller les utilisateurs, choisir, adapter (et développer si nécessaire) les méthodes d’analyse métabolomiques et protéomiques en fonction des objectifs des projets
* Mettre en œuvre expérimentalement la préparation des échantillons et réaliser les analyses MS (métabolomiqueset protéomiques)
* Traiter les données (analyser, interpréter et valider les résultats) et en garantir le suivi et la qualité
* Assurer un reporting régulier des projets et communiquer les résultats sous forme de rapports d'analyse
* Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous forme de présentations orales et de publications
* Assurer une veille scientifique et technologique dans ses domaines d'activité
* Appliquer et faire appliquer les règles d'hygiène et de sécurité
* Assurer le suivi métrologique des équipements du service
* Gérer et organiser les moyens techniques et les stocks des réactifs et consommables
* Participer aux tâches collectives au sein de l’équipe ainsi qu’à la formation des stagiaires



Conduite de projets : OUI

Encadrement : NON

Exposition aux risques professionnels : OUI

* Risques biologiques et chimiques faibles (laboratoire L1)


Connaissances transversales requises :

* Organisation et fonctionnement de la recherche et de l’enseignement supérieur en France
* Réglementation applicable à son domaine d’activité professionnelle
* Connaissance théorique approfondie des techniques de spectrométrie de masse ESI-MS et MALDI-TOF MS
* Connaissance théorique approfondie des méthodes de séparation par chromatographie liquide
* Connaissance théorique approfondie des méthodes de préparation et d’analyse par MS des échantillons de type métabolites/petites molécules
* Connaissance approfondie des méthodes et outils relatives aux traitements bioinformatiques et statistiques des données en métabolomique
* Connaissance théorique des méthodes de préparation des échantillons de type protéines et de leur analyse par des approches protéomiques de type bottom-up…

Savoir-faire :

* Bonne maîtrise pratique des méthodes de préparation des échantillons (métabolites/petites molécules) en vue de leur analyse par spectrométrie de masse
* Bonne maîtrise technique de la chromatographie UHPLC
* Bonne maîtrise technique des spectromètres de masse haute résolution (de préférence de type Orbitrap) et des méthodes d’acquisition DDA et DIA
* Concevoir et optimiser des expériences d’analyse MS en mode données dépendantes (DDA) et indépendantes (DIA)
* Bonne maîtrise pratique des méthodes et logiciels bio-informatiques relatifs à l’analyse quantitative et structurale (bases de données, réseaux moléculaires) des petites molécules et métabolites par spectrométrie de masse
* Bonne maîtrise pratique des méthodes et logiciels relatifs au traitement statistique de jeux de données de métabolomique
* Rédiger des documents scientifiques et des rapports d’analyse
* Respecter les principes et règles d’hygiène et de sécurité

Savoir-faire Transversaux :

* Bonne capacité organisationnelle (organisation expérimentale, gestion des délais)
* Bonne capacité d’initiative et d’adaptation
* Bonnes qualités rédactionnelles et de présentation orale
* Maîtrise à l’écrit et à l’oral des langues française et anglaise (niveau B2 ou plus)

Savoir-être :

* Bonnes capacités relationnelles et sens du travail dans un environnement multidisciplinaire
* Bonne capacité de raisonnement et d’analyse
* Curiosité, intérêt pour le développement technologique et aptitude à se former aux nouvelles techniques


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