Bioinformaticien-ne sur plateforme de génomique

Informations générales Organisme de rattachement Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE) Référence INRAE-CAMOB25-IE-BAP-5 Date de début de diffusion 18/11/2025 Date de parution 18/11/2025 Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en calcul scientifique Statut du poste Vacant Intitulé du poste Bioinformaticien-ne sur plateforme de génomique Descriptif de l'employeur L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. Description du poste Vous exercerez votre activité dans l'unité EPGV (Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux), unité INRAE située dans les locaux du CEA-IbFJ-Genoscope à Evry-Courcouronnes (91). L'EPGV est une plateforme de génomique dont les missions sont : 1) assurer la veille et les développements technologiques dans les domaines de la génomique et du génotypage ; 2) mettre à la disposition des équipes de recherche des outils de production de données à très haut débit, et d'analyse pour l'étude du polymorphisme des génomes dans le cadre de projets divers développés par les équipes INRAE ; 3) animer, valoriser et diffuser l'expertise technologique ; 4) fournir un appui bio-informatique aux équipes de recherche pour l'analyse des données produites sur la plateforme. L'unité compte 6 agents permanents dont deux ont des compétences en bioinformatique, vous viendrez renforcer cette expertise et contribuer à la valorisation des données NGS.Votre mission principale sera d'assurer les développements bio-informatiques menés par l'unité EPGV, associés aux évolutions technologiques et méthodologiques. Vous contribuerez à l'analyse et à la valorisation des données de séquençage courtes et longues lectures produites par la plateforme de génomique. Votre activité sera centrée sur l’analyse du polymorphisme ponctuel et structurel des génomes. Les analyses et l’interprétation des résultats se feront en interaction avec les biologistes moléculaires de l’unité et en collaboration avec les chercheurs coordinateurs de projets ; vous en assurerez le reporting. Vous réaliserez une veille technologique et scientifique pour identifier les approches innovantes que vous implémenterez. Votre travail s'inscrira dans la politique FAIR INRAE en faveur du partage, de l'accès, et de la réutilisation de l'information, de la donnée et de la connaissance scientifique. Vous développerez des solutions communes ou inter-opérables entre les 5 entités de l’infrastructure INRAE Genomics et également le Genoscope. Vous communiquerez vos résultats et activités au travers de différents réseaux métiers et conférences.Vous travaillerez dans l'environnement du CEA-IbFJ Genoscope localisé à Evry-Courcouronnes, et bénéficierez des nombreuses ressources disponibles localement (HPC, machines virtuelles, etc). Descriptif du profil recherché Formation recommandée : master bioinformatique / école d'ingénieur ou équivalent.Une double compétence biologie/bioinformatique et une première expérience en environnement HPC seraient appréciées.Connaissances souhaitées : - Algorithmique de la bioinformatique ;- Nouvelles Générations de Séquençage-NGS ;- Langages informatiques Python, R ;- Création et gestion de pipelines (Snakemake, Nextflow) ;- Notions de biostatistique ;- Rédaction de procédures, comptes-rendus ;- Anglais écrit/parlé.Aptitudes recherchées : - Autonomie / confiance en soi ;- Capacité d'adaptation ;- Rigueur / fiabilité ;- Sens du relationnel. Localisation du poste Europe, France, Île-de-France Géolocalisation du poste 91000 EVRY-COURCOURONNES Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 91000 EVRY-COURCOURONNES Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 6 Licence/diplômes équivalents Date de vacance de l'emploi 01/02/2026