Ingénieur en développement logiciel pour l'imagerie médicale

Contexte et atouts du poste

Contexte : NeuroVasc est un projet national, financé pour 4 ans par le programme PEPR Santé Numérique du plan national FRANCE 2030. NeuroVasc vise à développer un écosystème numérique optimal (fédérant une trentaine de sites hospitalo-universitaires) en intégrant des données multimodales (phénotypes, génomes, neuro-images) pour plus de 3 000 patients porteurs d'anévrismes intracrâniens (ICA). Cet écosystème sera déterminant pour i) mieux comprendre la physiopathologie des anévrismes intracrâniens et de l'AVC ischémique et ii) concevoir des modèles prédictifs pour une meilleure prise en charge des patients.
Shanoir (SHAring iN vivO Imaging Resources, Le poste nécessitera des déplacements en France dans le cadre d’un réseau déjà opérationnel d’ Hôpitaux Universitaires.

Mission confiée

La personne recrutée aura pour mission d’accompagner les partenaires cliniques contribuant au projet national NeuroVasc en facilitant le transfert d'images médicales de haute qualité acquises en routine clinique vers l'entrepôt de données Shanoir. Le second objectif est de contribuer au développement logiciel de Shanoir (expérience utilisateur, interopérabilité, etc.).

Cet accompagnement consistera à

1. coordonner le déploiement, sur site, de Shanoir Uploader dans les systèmes d'imagerie clinique (PACS)
2. monitorer l'acquisition d'images médicales de qualité grâce à des règles de contrôle qualité et un tableau de bord des données d'imagerie,
3. recueillir les besoins des cliniciens, techniciens, assistants de recherche et paramédicaux, pour améliorer l'expérience utilisateur et contribuer à l'évolution de Shanoir. Ces évolutions couvriront également la découvrabilité des jeux de données d'imagerie ainsi qu'une meilleure interopérabilité avec les infrastructures de données génomiques et cliniques développées dans NeuroVasc.

Principales activités

4. Coordonner le déploiement sur site de Shanoir Uploader dans les systèmes d'imagerie clinique (PACS)
5. Concevoir des règles de contrôle qualité pour les images médicales
6. Développer un tableau de bord des données d'imagerie pour monitorer la contribution des centres participants
7. Recueillir des besoins afin d’améliorer l'expérience utilisateur
8. Proposer des évolutions logicielles pour Shanoir
9. Contribuer à une meilleure interopérabilité de Shanoir avec les infrastructures de données cliniques et génomiques
10. Suivre les dernières avancées et les bonnes pratiques en imagerie médicale et en gestion de données.

Compétences

Connaissances

11. Maîtrise du développement logiciel dans environnement Linux
12. Maîtrise d’un langage de programmation parmi Python, Java
13. Connaissance des technologies du Web et des bases de données
14. Une connaissance des logiciels et outils d'imagerie médicale (PACS) et des visualiseurs d'images médicales serait un avantage
15. Méthodologies de gestion de projet
16. Anglais technique
17. Intérêt pour les sciences de la vie et la médecine

Savoir-Faire

18. Concevoir et développer un logiciel
19. Utiliser les outils de développement collaboratif et d’intégration continue
20. Rédiger des documents techniques

Présenter des résultats en Français et en Anglais

Avantages

21. Restauration subventionnée
22. Transports publics remboursés partiellement
23. Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
24. Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
25. Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
26. Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
27. Accès à la formation professionnelle
28. Sécurité sociale

Rémunération

29. Selon expérience profesionnelle