Au CHU de Nantes, nous sommes un collectif de 13 000 professionnel·le·s engagé·e·s et précurseur·euse·s, animé·e·s par la volonté de repousser les frontières de la santé. Nous portons une vision, celle de faire bouger les lignes avec tous les acteurs de santé du territoire pour améliorer la santé de tous.
Prouesse et proximité : nous assurons l'excellence des soins et de la recherche par l'approche multidisciplinaire, la culture de l'innovation et la force du compagnonnage.
Solidarité, exigence, curiosité, nos valeurs partagées guident nos actions et nous poussent à être toujours plus ingénieux, éclaireurs, activistes du soin, coopérateurs.
Nous explorons tous les possibles et sommes à la pointe de l'innovation. Nous voulons ouvrir de nouvelles voies et susciter l'espoir d'un avenir meilleur.
Notre mission en tant que premier employeur de la région : donner les capacités d'agir aux professionnel·le·s hospitalier·ère·s.
Chacun·e de vous est essentiel·le, c'est pourquoi nous sommes engagé·e·s pour cultiver vos talents, soutenir vos engagements et faire vivre nos valeurs.
Rejoignez l'aventure !
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Description du poste et Missions
Vos missions :
Vous mettez en place des outils d'analyse transcriptomique (RNAseq) adaptés aux leucémies, lymphomes, et autres hémopathies : identification de transcrits de fusion, profils d'expression, SNV, etc. Des essais de plusieurs algorithmes et la création d'un pipeline est attendue avec une sortie annotée et interprétable par les biologistes.
Vous assurez la maîtrise des pipelines d'analyse et leur traçabilité en adéquation avec les exigences de l'ISO 15189 et participez à la démarche d'accréditation des examens biologiques.
Vous contribuez à la traçabilité et à la documentation.
Vous êtes en charge de l'analyse de données de génomique (WES, panels ciblés) dans le cadre du soin et de la recherche.
Vous participez aux projets de recherche et de développement actuellement en cours ou à venir sur l'ADN tumoral circulant, en collaboration avec nos partenaires académiques.
Vous êtes en appui à l'administration du serveur en collaboration avec la Direction des Systèmes Numériques (DSN).
Département du lieu de travail : 44
Ville : Nantes
Expérience : 2-5 ans
Temps de travail hebdomadaire : Horaires normaux
Profil recherché
Diplôme / Formation : Diplôme d'ingénieur, Master 2 ou doctorat (PhD) en bioinformatique
Formations complémentaires requises : Formation ou expérience en analyse NGS, bases de données, développement de pipelines conformes à la norme ISO 15189
Expériences attendues : Minimum 2 ans d'expérience en bioinformatique, idéalement en génomique/transcriptomique humaine
Expérience dans un laboratoire à visée diagnostique appréciée
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