Post-doctorat en génomique des populations des chromosomes sexuels chez jaera (h/f)

Vos missions en quelques mots Missions : Participer au projet ANR SEXISOL, dirigé par Thomas Broquet : « Évolution de l’isolement sexuel dans le complexe d’espèces de crustacés Jaera albifrons ». Ce projet vise à tester des hypothèses relatives à deux questions complémentaires, au moyen d’une étude empirique du complexe Jaera albifrons. Comment l’isolement sexuel a-t-il pu évoluer ? Quel est précisément le rôle des réarrangements chromosomiques et des chromosomes sexuels (système ZW), qui ont été mis en cause dans le développement de l’isolement sexuel ? Activités : Le/la candidat.e retenu.e procédera, dans un premier temps, à la caractérisation, au niveau moléculaire, des chromosomes sexuels au sein de plusieurs espèces du complexe, en examinant notamment le degré de différenciation entre les chromosomes Z et W, l’ampleur de leur dégénérescence, les réarrangements chromosomiques ainsi que les modalités de compensation de dosage. Le/la candidat.e s’attachera ensuite à reconstituer leur dynamique évolutive à l’échelle du complexe d’espèces Jaera albifrons. Dans un second temps, le rôle des chromosomes sexuels en tant que barrières reproductives à l’hybridation introgressive sera évalué au moyen d’analyses génomiques (genome-wide scans) et d’approches d’inférence fondées sur des modèles. Enfin, des données d’expression seront analysées afin de quantifier le dimorphisme sexuel de l’expression, la divergence interspécifique des profils d’expression ainsi que les phénomènes de dérégulation chez les hybrides. Contexte de travail : L’ISEM est un institut de recherche consacré à l’étude de l’origine de la biodiversité, de ses dynamiques ainsi que des mécanismes et processus évolutifs qui lui sont associés. Il regroupe environ 250 scientifiques répartis au sein de quatre départements de recherche. Montpellier est une ville universitaire dynamique située dans le sud de la France. Plusieurs séjours à la Station Biologique de Roscoff (France) sont prévus afin de favoriser les interactions au sein du consortium ANR. Cette station constitue un laboratoire de biologie et d’écologie marines réunissant près de 200 scientifiques, dont les travaux portent sur l’étude des organismes marins et la compréhension du fonctionnement d’écosystèmes marins complexes et dynamiques. Elle est située à Roscoff, village maritime de la côte nord de la Bretagne, en France. Profil recherché Competences : La personne candidate devra être titulaire d’un doctorat et posséder une solide formation en génétique des populations et en évolution. Le profil recherché correspond à une personne motivée, dotée de bonnes compétences en communication, capable de travailler de manière autonome et en équipe en s’intégrant efficacement dans ce projet collaboratif (échanges avec thésards et ingénieurs bioinformatique). Une expérience préalable dans l'un des domaines suivants sera un avantage : • la génomique des populations (short-reads et long-reads). • la transcriptomique (short-reads). • compétences en programmation (par ex. R, Python, bash, C). • expérience du calcul à haute performance (par ex. slurm). Veuillez fournir : • une lettre de motivation décrivant les projets de recherche passés et l'intérêt pour le poste (deux pages maximum). • un CV, comprenant une liste de publications. • les noms et adresses électroniques d'au moins deux personnes de référence. Contraintes et risques : NA Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français Seuil