🔬 L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.
Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.
Au sein du Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur (CRBIP), la Collection de l'Institut Pasteur (CIP) est une des plus anciennes collections microbiennes au monde, accueillant plus de 25000 souches bactériennes représentant 5500 espèces différentes, plusieurs centaines de levures et champignons filamenteux.
Depuis le début du XXe siècle, la CIP continue de s'enrichir accueillant les souches déposées par les chercheurs de l'Institut Pasteur et également du monde entier. La CIP assure ainsi sa mission de mise à disposition de la communauté scientifique des souches microbiennes et leur données associées tout en garantissant stabilité et parfaite caractérisation.
La Collection de l'Institut Pasteur (CIP) recherche un ingénieur de recherche pour contribuer au projet « MALDIBANK » dans le cadre du programme Horizon Europe. L'objectif principal de MALDIBANK est de mettre en place une base de données MALDI-TOF MS multidomaines et en libre accès, couvrant un large éventail de taxons microbiens issus de divers environnements. Cette base de données s'appuiera sur une infrastructure robuste, facilitant l'identification rapide et précise des micro-organismes.
La personne recrutée sera principalement impliquée dans deux axes du projet :
A – Fournir une base de données de spectres MALDI-TOF MS, couvrant différents types de micro-organismes
B – Démontrer l'application des outils développés par le projet, afin de démontrer leur applicabilité et leur fiabilité dans différents domaines microbiologiques.
🎯 Les principales activités consisteront à :
- Assurer la curation et la sélection des spectres de référence MALDI-TOF MS existants
- Créer de nouveaux spectres de référence
- Définir des procédures opérationnelles standard (SOP)
- Explorer les possibilités de caractérisation de souches microbiennes à l'aide de spectres d'ions négatifs
- Améliorer la détection de souches résistantes aux antimicrobiens (RAM) par l'application des nouveaux outils d'IA
- Explorer la variation intra-espèce pour la surveillance épidémiologique à l'aide des spectres validés
- Participer aux réunions du consortium et dialoguer avec les autres partenaires du projet
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