Mission :
En tant qu'organismes sessiles, les plantes sont exposées à divers stress environnementaux nécessitant des réponses physiologiques, cellulaires et nucléaires. L'un de ces facteurs de stress est constitué des composantes ultraviolettes de la lumière solaire, spécifiquement les UV-A et UV-B, qui posent des défis pour de nombreux organismes. Ces rayons UV peuvent pénétrer les tissus eucaryotes et affecter directement l'intégrité du génome en causant des lésions de l'ADN.
Au sein d'un consortium plus large étudiant divers aspects de la réponse nucléaire à l'irradiation UV, l'objectif de ce projet est d'étudier comment le repliement 3D de la chromatine est affecté par le stress induit par les UV et comment il y répond. Nous nous intéressons non seulement à la manière dont l'irradiation UV peut altérer les motifs de repliement 3D dans les noyaux d'Arabidopsis thaliana, mais aussi à la question de savoir si certaines caractéristiques du repliement 3D de la chromatine peuvent atténuer les effets nocifs de l'irradiation UV.
Activités :
Pour ce projet de recherche, nous utiliserons une large gamme d'outils en génomique, biologie moléculaire et bio-informatique. Le projet inclura la réalisation de plusieurs expériences Hi-C sous différents régimes lumineux, stades de développement et contextes génétiques. Compte tenu de la grande quantité de données collectées, un second accent de ce projet sera mis sur la formation de l'ingénieur de recherche (H/F) aux outils bio-informatiques et leur exécution ultérieure. Cela permettra l'analyse des données Hi-C et leur intégration avec d'autres ensembles de données épigénomiques obtenus par le consortium. En parallèle, la personne retenue est invitée à s'engager dans un projet secondaire aligné sur les axes de recherche de l'équipe.
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