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Doctorant(e) (h/f) : modélisation théorique et statistique des boucles de rétroaction éco-évolutives à partir de séries temporelles abondance-phénotype

Gif-sur-Yvette
CDD
Statistiques
Publiée le Il y a 9 h
Description de l'offre

Description du Poste Sujet De Thèse Contexte scientifiqueLes boucles de rétroaction éco-évolutives décrivent les interactions réciproques entre l’adaptation génétique des organismes et leur environnement biotique ou abiotique. Si des composantes environnementales comme la température ou la compétition imposent une sélection naturelle sur la morphologie, la physiologie et le comportement, les organismes modifient en retour leur environnement par leur abondance et leurs traits, influençant ainsi le fonctionnement et la stabilité des écosystèmes.Malgré leur pertinence théorique et appliquée, ces boucles restent mal comprises sur le plan empirique. Peu d’outils théoriques ou statistiques existent actuellement pour les détecter à partir de données observationnelles en milieu naturel et pour prédire leurs conséquences sur la dynamique des populations et l’évolution des traits.Présentation du projetCe projet se concentre sur une boucle de rétroaction potentiellement majeure entre la taille corporelle et la densité de population. La taille corporelle est un trait écologique clé susceptible d’influencer la reproduction des individus. En retour, la densité de population affecte également la taille corporelle, soit par des réponses plastiques, soit en modifiant l’optimum évolutif via l’intensité de la compétition.Le projet a une double finalité, fondamentale et méthodologique :(i) d’un point de vue fondamental, déterminer les conditions dans lesquelles les boucles de rétroaction éco-évolutives émergent en milieu naturel ;(ii) d’un point de vue méthodologique, évaluer les stratégies d’échantillonnage et les outils de modélisation permettant de détecter ces boucles.Le/la doctorant(e) développera un cadre théorique et exploitera des outils statistiques avancés pour détecter les rétroactions éco-évolutives à partir de séries temporelles abondance-taille corporelle. Plus précisément, il/elle étendra un modèle éco-évolutif de base récemment développé par notre consortium pour tenir compte d’une complexité biologique croissante (par exemple, générations chevauchantes, structure de population) ou d’effets d’échantillonnage spécifiques, tels qu’un taux de capture limité.Compétences recherchéesNous recherchons un(e) candidat(e) titulaire d’un master en mathématiques appliquées, biologie théorique ou écologie, attiré(e) par des questions fondamentales en écologie et évolution. Une solide formation en programmation (R, Python) et en statistiques (approches bayésiennes et fréquentistes ; des connaissances en apprentissage automatique seraient un atout) est requise. Votre Environnement de Travail Ce doctorat est déjà financé dans le cadre du projet collaboratif ANR BackOut (boucles de rétroaction éco-évolutives : du laboratoire au terrain), qui s’étend de 2025 à 2029 et implique 6 partenaires nationaux et internationaux. Le/la doctorant(e) sera co-encadré(e) par Arnaud Le Rouzic (chercheur CNRS, EGCE, IDEEV, Université Paris-Saclay) et Eric Edeline (directeur de recherche INRAe, DECOD, Rennes), et bénéficiera d’interactions avec les autres partenaires du projet (6 réunions virtuelles/an), notamment Julien Papaïx (INRAe BioSP) et Willem Bonnafé (Université d’Oxford).Le/la doctorant(e) sera basé(e) à l’unité de recherche EGCE à Gif-sur-Yvette, à environ 35 km au sud de Paris, sur le nouveau campus Paris-Saclay. L’EGCE fait partie de l’Institut de la Diversité, Écologie et Évolution. Le groupe « Génomes et Évolution » d’Arnaud Le Rouzic accueille 8 chercheurs et environ 15 étudiants et post-doctorants internationaux. Des réunions physiques régulières avec le co-encadrant seront organisées. Rémunération et avantages Rémunération La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€ À propos de l’offre Référence de l’offre UMR9191-ARNLER-008 Section(s) CN / Domaine de recherche Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés Expérience souhaitée 1 à 4 années À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche

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