Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Informations générales Organisme de rattachement Nantes Université Référence 2026-2196723 Date de début de diffusion 17/02/2026 Date de parution 17/02/2026 Date de fin de diffusion 11/03/2026 Localisation Nantes Intitulé long de l'offre Ingénieur-e biologiste en analyse de données Date limite de candidature 10/03/2026 Nature du contrat CDD de 6 mois Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en biologie - SVT Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur-e biologiste en analyse de données Descriptif de l'employeur Nantes Université est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d’université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) ainsi que Centrale Nantes, l’école des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire et l’École Nationale Supérieure d’Architecture de Nantes. Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l’excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations, dans tous les domaines de la connaissance. Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d'études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon. Description du poste Missions Notre groupe a accès à des données cliniques et à plusieurs données omiques longitudinales multiples (métabolome, lipidome, protéome) pour deux grandes cohortes françaises de patients gravement malades. Les missions de l’ingénieur seront de : · caractériser l'effet de la pneumonie sur chaque omique, · réaliser une intégration multi-omique · évaluer si les signatures identifiées, par exemple la reprogrammation métabolique ou lipidique, sont associées à des événements cardiovasculaires ultérieurs. Le candidat retenu sera chargé des analyses bioinformatiques du séquençage immunologique, de l'interprétation des analyses multi-omiques et de la rédaction d'un manuscrit. Activités principales · Concevoir, Développer, déployer et maintenir des méthodes d’analyses de données omiques : Faire une revue de littérature, choisir des outils, les tester, les déployer sur le cluster d’analyse, les maintenir à jour et les utiliser dans le cadre de projets de recherche en cours au sein de l’équipe. · Analyser des données de lipidomique, métabolomique et protéomique : Controler la qualité, nettoyer, ordonner, normaliser, comparer les données et représenter les résultats scientifiques. · Interagir avec les autres membres de l’équipe : Discuter des choix méthodologiques, des résultats. Acquérir les connaissances sur le contexte biologique nécessaires à chaque projet. Participer à la valorisation des résultats, dont lors de la rédaction des publications scientifiques. RETROUVEZ LA FICHE DE POSTE EN INTEGRALITE : https://www.univ-nantes.fr/universite/recrutement/nantes-universite-recrute-un-e-ingenieur-e-biologiste-en-analyse-de-donnees-cr2ti Conditions particulières d'exercice Environnement de travail : · Bureau partagé · Travail en équipe Rythme de travail : · Horaires fixes ou variables · Contraintes calendaires Conditions de travail : · Usage d’un écran · Utilisation d’applications métiers Descriptif du profil recherché Formation et/ou qualification : Doctorat (ou qualification équivalente) en bioinformatique. Un diplôme supplémentaire en biologie serait un atour pour l’intégration translationnelle du projet. Un très bon niveau en langage de programmation (Python ou R) est attendu. Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : Une expérience ayant permis l’acquisition d’un solide savoir-faire en bio-informatique (langages de programmation, modélisation statistique, analyse prédictive et intégration de données omiques (métabolome, protéome, microbiome, transcriptome), d’une bonne expertise en immunologie et la capacité à travailler en équipe multidisciplinaire est bienvenue. La publication d’articles dans des journaux scientifiques reconnus en tant que principal auteur sera appréciée. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) 33,4k à 48,37k brut/annuel Informations complémentaires Télétravail possible Oui Localisation du poste Europe, France, Pays de La Loire, Loire Atlantique (44) Géolocalisation du poste 1, quai de Tourville 44035 Nantes Lieu d'affectation (sans géolocalisation) Nantes Centre Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Compétences attendues Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires : -Connaissances théoriques et appliquées en métabolomique, lipidomique et protéomique. -Maitrise des principes F.A.I.R. -Maitrise de l'anglais scientifique Savoir-faire opérationnels : -Garantir la qualité de l'analyses de données -Maitriser l'environnement linux -Maitriser les langages R et Python -Transmettre ses résultats -Justifier ses choix -Organiser son travail -Respect de la confidentialité. Savoir-être : -Sens aigu de l'organisation -Sens critique constructif -Prise d'initiatives -Rigueur scientifique -Relationnel respectueux et pro-actif Documents à transmettre L'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire Date de vacance de l'emploi 16/03/2026 Mail à qui adresser les candidatures (bouton postuler) recrutement-polesante-149089@emploi.beetween.com Contact 1 Antoine ROQUILLY – antoine.roquilly@univ-nantes.fr