Chercheur (h/f) en biologie structurale computationnelle

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UPR2357-PATACH-008 Date de début de diffusion 10/11/2025 Date de parution 24/11/2025 Date de fin de diffusion 01/12/2025 Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste Chercheur (H/F) en biologie structurale computationnelle Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : Nous recherchons un chercheur (H/F) hautement motivé, disposant d’une solide expérience en biologie structurale computationnelle. Le chercheur (H/F) travaillera au développement d’approches informatiques basées sur l’intelligence artificielle pour la modélisation de structures protéiques et des interactions protéines-ligands (métabolites). En utilisant des modèles moléculaires multi-échelles, le projet vise à prédire les caractéristiques structurales des transporteurs de gibbérellines (GA), une phytohormone clé impliquée dans divers processus de croissance tout au long du cycle de vie des plantes. Les principaux objectifs seront la prédiction des résidus interagissant aux GA, leur validation par analyses moléculaires, ainsi que l’identification de nouveaux transporteurs de GA sur la base de leurs caractéristiques structurales. Activités : Activités principales: •Réaliser des alignements multiples de séquences de transporteurs de plantes à l’aide de profils phylogénétiques. •Prédire et analyser les structures tridimensionnelles des transporteurs de GA et de leurs complexes à l’aide d’outils de modélisation (AlphaFold2/AF2-Multimer, AF3 Server, DMFold, DeepMSA2, etc.). •Prédire la position spatiale du ligand GA dans la cavité interne des transporteurs à l’aide d’outils de docking moléculaire (par ex. AutoDock Vina/GNINA, DiffDock ou EquiBind). •Explorer les déterminants moléculaires et les résidus de liaison impliqués dans la reconnaissance des GA par analyses structurales et visualisation moléculaire (ChimeraX). •Prédire de nouveaux transporteurs de GA et leur activité directionnelle de transport. •Travailler de manière autonome et responsable au sein d’une équipe multidisciplinaire. Activités secondaires: •Participer au fonctionnement général du laboratoire. •Contribuer aux réunions d’équipe et à la diffusion des connaissances scientifiques au sein du groupe. •Collaborer étroitement avec les autres membres du projet pour la validation expérimentale des modèles prédits. Contexte de travail : Le poste est rattaché à l’équipe du Dr Patrick Achard au sein de l’Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP, UPR2357), en étroite collaboration avec les généticiens et biologistes moléculaires du projet ANR MOVE. L’IBMP est l’un des plus grands instituts du CNRS dédiés à la biologie végétale, situé sur le campus de l’Esplanade de l’Université de Strasbourg. L’institut conduit des recherches de pointe visant à relever les défis liés à la nutrition, la santé et l’environnement à travers l’étude des processus fondamentaux de la vie des plantes. Le chercheur (H/F) bénéficiera d'un espace bureau avec ordinateur et d'un environnement technique adapté. L'IBMP est accessible en transport en commun. Stationnement vélo facilité. Restauration administrative sur place. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : •Doctorat en biologie computationnelle, bioinformatique structurale, ou discipline connexe. •Solides compétences en modélisation structurale des protéines et/ou en étude des interactions protéines–ligands. •Maîtrise des environnements de travail en ligne de commande (Linux, Bash, Conda, Python). •Des compétences en dynamique moléculaire, chimie des protéines ou phylogénétique seront considérées comme des atouts majeurs. •Un intérêt pour l’acquisition de compétences expérimentales (tests in vitro/in planta) sera apprécié. Contraintes et risques : Aucun risque particulier. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) entre 3071,50€ et 3501,51€ mensuel brut (selon expérience) Localisation du poste Europe, France, Grand Est, Bas Rhin (67) Géolocalisation du poste STRASBOURG Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 67084 STRASBOURG (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)