Ingénieur d'études en bioinformatique structurale et modelisation (h/f)

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR7256-ALASCH-001 Date de début de diffusion 27/04/2026 Date de parution 01/05/2026 Date de fin de diffusion 18/05/2026 Intitulé long de l'offre Ingénieur d'études en bioinformatique structurale et modelisation (H/F) Date limite de candidature 18/05/2026 Nature du contrat CDD d'1 an Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en calcul scientifique Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur d'études en bioinformatique structurale et modelisation (H/F) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : Nous recrutons un ingénieur (H/F) en bioinformatique (ou biologie structurale computationnelle) pour travailler sur un projet à l’interface de la microbiologie, de la biologie structurale et de la bioinformatique. Ce projet concerne le complexe membranaire du système de sécrétion de type VI (T6SS), et vise à étudier son intégration dans l’enveloppe bactérienne ainsi que son impact sur la physiologie cellulaire. La mission principale consistera à analyser et intégrer des données protéomiques (notamment issues de spectrométrie de masse top-down) et des prédictions structurales (AlphaFold) afin de caractériser les réseaux d’interactions protéiques impliqués dans l’assemblage et le fonctionnement du T6SS. Activités : - Exploitation de prédictions structurales (AlphaFold) pour caractériser les interactions protéine–protéine et les réseaux associés. - Développement d’approches bioinformatiques pour la modélisation structurale, l’analyse de réseaux (PPIN) et le data mining à grande échelle. - Analyses génomiques et évolutives pour explorer la conservation, la diversité et les co-évolutions des composants du T6SS et de leurs partenaires. - Exploitation et intégration de données protéomiques (notamment AP-MS) pour identifier les partenaires d’interaction du T6SS. - Collaboration étroite avec les équipes expérimentales pour interpréter les résultats et orienter les analyses. - Développement de pipelines reproductibles et visualisation des résultats (figures, rapports scientifiques). Contexte de travail : Le travail sera effectué à l’IGS (Laboratoire Information Génomique et Structurale), en étroite collaboration avec l’équipe VN2M (Virulence Nano-Macromolecular Machinosome) du LCB (Laboratoire de Chimie Bactérienne) dans le cadre d’un projet collaboratif déjà en cours. Au sein du LCB, l’équipe « Virulence Nano-Macromolecular Machinosome » (VN2M), dirigée par Eric Durand, étudie l’architecture et le fonctionnement de la nanomachine T6SS via des approches génétiques, biochimiques et structurales. Le laboratoire dispose d’un environnement technique complet pour la production de biomasses bactériennes et la caractérisation structurale (microscopie électronique, cristallographie, etc.). En collaboration avec l’IGS, l’ingénieur·e contribuera à des approches bioinformatiques innovantes, notamment la modélisation dynamique de complexes protéiques et l’exploration d’interactions protéine-protéine, dans un cadre stimulant et pluridisciplinaire. Le laboratoire IGS est un pionnier et un leader mondial dans l'étude des virus géants. Nous avons participé à la découverte de Mimivirus, le premier virus géants et découvert les trois autres familles connues. La force du laboratoire IGS réside dans la coexistence d'une équipe de bioinformaticiens et d'une équipe d’expérimentalistes, permettant d’aller de l'isolement de nouveaux micro-organismes à leur caractérisation complète par la combinaison d’approche i Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : - Formation : Master ou diplôme d’ingénieur en bioinformatique, biologie computationnelle ou biologie structurale. Une expérience en analyse de données protéomiques et/ou en modélisation structurale est un plus. - Compétences techniques : 1. Maîtrise de Python et/ou R pour l’analyse de données. 2. Expérience avec des outils de modélisation structurale (AlphaFold) et de visualisation et analyse des modèles en 3D appréciées. 3. Compétences en analyse de réseaux d'interactions protéiques (PPIN) avec le logiciel cytoscape ou python-NetworkX appréciées. 4. Compétences en analyse génomique et évolutive (comparaison de séquences, phylogénie, co-évolution) appréciées. 5. Utilisation de Git pour la gestion de code et des environnements reproductibles. 6. Anglais lu, écrit et parlé (lecture d’articles, interactions internationales). - Qualités personnelles : Rigueur, autonomie, esprit d’initiative et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire. Contraintes et risques : Pour postuler au poste à l'IGS, le candidat doit envoyer son CV avec une liste complète des publications, une lettre de motivation. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) entre 2571,89 et 3817, 32 € brut /mois Localisation du poste Europe, France, Provence-Alpes-Côte-D'Azur, Bouches du Rhône (13) Géolocalisation du poste MARSEILLE 09 Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 13288 MARSEILLE 09 (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Informatique, traitement de l'information, réseau de transmission des données Langues Français (Seuil)