En lien permanent avec les équipes dédiées à la Recherche et au Développement de procédé de TreeFrog, et au sein de l’équipe de Développement Analytique, vous aurez en charge l’exécution des activités de développement de méthodes de biologie moléculaire (dPCR, qPCR) et de suivi des prestations externes de séquençage génomique et dPCR, afin de caractériser les cellules iPSC cultivées en 2D et 3D,et produits de thérapie cellulaire développés par Treefrog.
Vos principales activitésseront :
Développement des méthodes
- Compréhension et définition au cas par cas des besoins des équipes de Recherche et Développement en matière d’analyses en dPCR/qPCR et en séquençage pour le suivi de l’intégrité génomique des cellules pluripotentes et des produits issus de culture cellulaire
- Développement des méthodes analytiques dPCR/qPCR adaptées aux projets, au regard des besoins des équipes, des exigences réglementaires et de la littérature scientifique existante
- Participation à la veille technologique concernant de nouvelles méthodes analytiques et à la mise en place de nouvelles méthodes dans le domaine de la biologie moléculaire-génomique, y compris la recherche de sous-traitants pour la partie séquençage
Réalisation des analyses
- Mise en place de l’activité dPCR/qPCR pour support en routine au laboratoire
o Respect du système de traçabilité des expériences et de leurs résultats
o Respect des règles EHS et de marche en avant du laboratoire
o Retour d’expérience sur les protocoles existants dans une démarche d’amélioration continue des méthodes analytiques
- Suivi de la sous-traitance des analyses de séquençage (Optical Genome Mapping - Bionano, Whole Genome Sequencing long read – PacBio, Whole Exome Sequencing short read - Illumina)et des analyses externalisées en ddPCR:
o Suivi de la réalisation des analyses en respectant le cahier des charges et les délais définis avec les équipes
o Suivi des rendus de résultats analytiques (forme directe et/ou rapport et/ou système de reporting).
o Suivi des contrats de confidentialité, des envois d’échantillons, des données brutes et de la facturation de ces prestations
o Collaboration étroite avec la manager du pôle Bio-informatique pour le rendu de résultat de séquençage
- Reporting et force de proposition dans les équipes projets dédiés
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