Ingénieur-e en microbiologie

Informations générales Organisme de rattachement Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE) Référence INRAE-OT-27927 Date de début de diffusion 02/12/2025 Date de parution 17/12/2025 Date de fin de diffusion 31/01/2026 Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Technicienne / Technicien en biologie - SVT Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur-e en microbiologie Descriptif de l'employeur L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. Description du poste Vous intégrerez l’UMR GenPhySE, unité spécialisée dans l’étude de la génétique, de la physiologie et des systèmes microbiens associés aux animaux d’élevage. Vous travaillerez au sein d’équipes interdisciplinaires mobilisant microbiologie, biotechnologies, analyses moléculaires et écologie microbienne.Vous bénéficierez d’un environnement composé de plateformes technologiques, d’équipements analytiques avancés et d’un réseau de collaborations internes (INRAE) et externes (notamment pour des activités de développement de biosenseurs).Votre mission consistera à assurer des activités expérimentales de microbiologie, de biochimie et d’analyses moléculaires au service des projets de recherche menés par l’unité. Vous contribuerez à la mise en œuvre, au suivi et à la validation des protocoles de laboratoire, en interaction avec les chercheurs, ingénieurs et techniciens de l’équipe.Vous serez plus particulièrement en charge de :1. Analyses moléculaires: dans le cadre du projet CASDAR CHARME, vous réaliserez des extractions d’ADN à partir d’échantillons microbiens (contenus digestifs). Vous participerez à la préparation des bibliothèques pour séquençage (Illumina ou équivalent) selon les recommandations publiées pour la métagénomique ou l’amplification ciblée visant à relier performances de croissance du porc avec la diversité de son microbiote.2. Fermentations anaérobies et mesures : Vous mettrez en œuvre des fermentations microbiennes en anaérobiose (cultures discontinues). Vous assurerez la préparation des milieux et du substrat en simulant la digestion haute par le protocole INFOGEST, l’inoculation sous atmosphère contrôlée, le suivi des cinétiques de production métabolique, la traçabilité des conditions expérimentales dans le cadre du projet PHASE FermentEnterotypig. Vous pourrez participer à la mise en place d’une méthode de quantification du lactate par chromatographie liquide haute performance (HPLC). Vous serez impliqué·e dans le développement et l’optimisation de la méthode (colonne, phase mobile, calibration), la préparation des échantillons et l’exécution des analyses.Vous prendrez en main et utiliserez le système GC déjà opérationnel au laboratoire pour mesurer H₂ et CO₂ produits lors des fermentations en réalisant l’injection des échantillons gazeux.3. Participation au développement de biosenseurs: Vous contribuerez à des tests expérimentaux, à la validation fonctionnelle et aux mesures réalisées dans le cadre de collaborations. Ces travaux s’appuieront sur le développement réalisé par Ana Zuniga pour détecter le propionate et les acides biliaires et contribueront à caractériser les fermentations anaérobies dans le cadre d’un projet ANR en cours de rédaction. Descriptif du profil recherché Formation recommandée : Master en microbiologieConnaissances souhaitées : Une formation intégrant des travaux pratiques en anaérobiose ou en chromatographie constitue un atoutExpérience appréciée : Travail dans un environnement de recherche académique ou plateforme technologique.Aptitudes recherchées :Capacité à apprendre progressivement des techniques avancées avec accompagnement.Sens de l’organisation, autonomie croissante et gestion fiable des séries expérimentales.Goût pour le travail en équipe et les interactions techniques avec chercheurs/ingénieurs.Capacité à documenter les résultats, tenir un cahier de laboratoire structuréMotivation pour travailler en anaérobiose et sur équipements analytiques.Ouverture à des missions ponctuelles en France. Localisation du poste Europe, France, Occitanie Géolocalisation du poste 31320 CASTANET TOLOSAN Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 31320 CASTANET TOLOSAN Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 5 Diplômes de niveau bac 2 Date de vacance de l'emploi 01/04/2026