Vos missions en quelques mots Missions : Choisir, développer et mettre en œuvre un pipeline standardisé pour l’analyse de données de spatiales transcriptomiques (10XGenomics Xenium) dans un contexte de recherche en neurobiologie (coupe de cerveau de souris). Le/la candidat(e) mènera trois projets en parallèles pour trois équipes de recherche de l’IPMC. Ce projet comporte une dimension de développement méthodologique visant à implémenter des solutions innovantes pour l’études des ARNs au niveau subcellulaire (projections neuronales) majoritairement éludés par les solutions bioinformatiques standards actuelles. Activités : Choix et adaptation des protocoles d’analyse des données de transcriptomique spatiale dans le cadre des projets scientifiques réalisés, mise en œuvre des analyses et contrôles qualité Rédaction / mise à jour des rapports d'études, conduites de réunions de projets régulières Rédaction d’articles scientifiques, figures, méthodes Participation à la veille scientifique et technologique du domaine Implémentation d’un package python pour la mise en œuvre d’analyse subcellulaire en application aux thématiques étudiées dans les projets de recherches des équipes. Contexte de travail : Expérience opérationnelle sur serveurs Unix/Linux. Maitrise des logiciels d'analyse statistique (Python, R). Bonnes connaissances en biologie. Aptitude à la communication orale et écrite (français/anglais). Capacité au travail en équipe, dans le cadre de multiples collaborations avec des chercheurs, doctorants, post-doctorants, ingénieurs. Capacité d'initiative dans l'organisation générale et quotidienne. Le poste est à pourvoir au sein de l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire à Sophia Antipolis (Alpes Maritimes). L'IPMC regroupe 21 équipes de recherche et des services communs pour un effectif global de plus de 250 personnes. La personne recrutée sera localisée sur le hub de bioinformatique de l’IPMC, regroupant 8 bioinformaticiens experts en analyse de transcriptomique spatiale. Il travaillera en étroite collaboration avec les trois équipes de recherche impliquées et aura pour mission de mener à bien les projets de recherche en transcriptomique spatiale de ces équipes. Profil recherché Competences : Connaissances en biologie moléculaire et cellulaire et en génomique Capacités à comprendre la biologie des systèmes étudiés Expert en développements python et en statistiques Capacité à travailler en étroite collaboration avec les collaborateurs biologistes. Aptitude à la communication orale et écrite (français/anglais). Contraintes et risques : Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR. Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français Seuil
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.