Ingénieur bioinformatique (h/f) - transcriptomique unicellulaire et spatiale

Portail > Offres > Offre UMR7275-KEVLEB-001 - Ingénieur bioinformatique (H/F) - Transcriptomique unicellulaire et spatiale


Ingénieur bioinformatique (H/F) - Transcriptomique unicellulaire et spatiale


Date Limite Candidature : vendredi 29 août 2025 23:59:00 heure de Paris

Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler


Informations générales

Intitulé de loffre : Ingénieur bioinformatique (H/F) - Transcriptomique unicellulaire et spatiale
Référence : UMR7275-KEVLEB-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : VALBONNE
Date de publication : vendredi 8 août 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date dembauche prévue : 1 novembre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : entre 3175 et 3437 euros bruts mensuels selon expérience
Niveau détudes souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : E - Informatique, Statistiques et Calcul scientifique
Emploi type : Cheffe ou chef de projet / experte ou expert en ingenierie des systemes dinformation


Missions

LIPMC est un centre dexcellence financé par le CNRS, lINSERM et lUniversité Côte dAzur, qui compte plus de 200 scientifiques, étudiants et personnels de soutien. Ce poste est destiné à un·e biologiste computationnel·le motivé·e pour lidentification de nouvelles thérapies dans les troubles du neurodéveloppement grâce à lanalyse computationnelle de données hautement complexes en transcriptomique spatiale et unicellulaire. Vous serez responsable de la conception et du développement dun pipeline danalyse basé sur des méthodes informatiques de pointe pour lanalyse dexpériences de transcriptomiques spatiales basées sur lanalyse dimages.


Activités

• Dans votre nouveau rôle, vous appliquerez des méthodes de pointe pour analyser et intégrer des données de transcriptomique spatiales et unicellulaires afin didentifier les processus modulés,
• En collaboration avec un groupe dexperts et les plateformes de l’IPMC, vous contribuerez au traitement, au contrôle qualité et à lannotation des données spatio-cellulaires afin de garantir les plus hauts standards de qualité,
• Vous présenterez les résultats danalyse aux membres de votre équipe projet et collaborateurs,
• De plus, vous contribuerez au développement des compétences en testant, documentant et discutant les nouvelles méthodes et les nouveaux flux de travail au sein de l’IPMC.


Compétences

• Vous êtes titulaire dun BAC+5 minimum (ou dun diplôme dingénieur) en bioinformatique, biologie computationnelle, mathématiques ou dune expérience équivalente, et justifiez dau moins 12 mois dexpérience sur un poste similaire,
• Expérience en analyse de données spatiales et transcriptomique unicellulaire, idéalement pour des plateformes spatiales basées sur lanalyse d’image (Xenium, Merscope),
• Expérience en analyse statistique de données et en méthodes dapprentissage automatique pour lanalyse de données omiques selon les principes FAIR,
• Maîtrise de R ou Python, expérience avec le contrôle de version (Github/Bitbucket), les outils de conteneurisation (Docker/Singularity) et les gestionnaires de workflows (Snakemake),
• Excellentes compétences en communication, présentation claire de sujets techniques,
• Capacité à rédiger des rapports de synthèse et à les présenter oralement (en anglais et en français) lors des réunions de projet



Contexte de travail

En étroite collaboration avec léquipe de recherche, le poste sera intégré au pôle de biologie computationnelle de lIPMC (CoBiODA) composé de 6 analystes de données multi-omiques produites par les plateformes technologiques de lIPMC.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par lautorité compétente du MESR.


J-18808-Ljbffr