Vos missions
Sous l'autorité du Chef de l'Unité Virologie, immunologie et écotoxicologie des poissons (VIMEP), vous participerez à l'optimisation des processus d'évaluation du bien-être de poissons, au développement d'outils de monitoring et à la mise en place d'un nouveau poisson modèle. Ces travaux seront menés dans le cadre de différents projets, en relation avec différentes unités Anses (Epidémiologie, Santé et Bien-Etre à Ploufragan et Epidémiologie et Appui à la Surveillance à Lyon) et d'autres partenaires.
Votre équipe
L'unité VIMEP est Laboratoire national de référence (LNR) pour les maladies réglementées des poissons et assure à ce titre un certain nombre de missions d'appui scientifique et technique, notamment des activités analytiques en virologie, sérologie et biologie moléculaire (accréditation COFRAC n°1-2251 selon le référentiel ISO 17025). Elle développe en parallèle des activités de recherche sur les agents infectieux, l'impact de polluants anthropiques sur la santé des poissons - en intégrant le développement d'outils d'analytiques et d'approches transversales (utilisation de challenges infectieux pour évaluer l'impact de polluants sur l'immunité par exemple), la mise au point de stratégies de contrôle et de prévention des maladies, ou encore les effets du changement climatique,. ;
L'équipe, composée d'une quinzaine de personnes aux compétences multiples et complémentaires, est localisée sur le site IFREMER de Brest (Finistère).
Quotidien
Activité 1 : Améliorer l'évaluation des effets de stress environnementaux sur la truite arc en ciel :
Participer à la définition de grilles de scoring et à l'identification de marqueurs pertinents de l'état de bien-être / de santé ;
Participer à la mise en place de méthodes simples de suivi de certains indicateurs ;
Réaliser le suivi des animaux soumis à des stress (multi-exposition chimique/virus/toxine ; hyperthermie, .) ;
Synthétiser et analyser les résultats des mesures ;
Contribuer à la formation du personnel aux outils développés/optimisés.
Activité 2 : Participer au développement d'un monitoring vidéo adapté à la détection des signes d'infection virale chez le bar Européen :
Identifier le matériel nécessaire / concevoir le système le plus adapté à l'acquisition d'images ;
Participer à la définition du protocole de prise d'images ;
Gérer les prises d'images avant et après infection en intégrant en complément un suivi visuel (grille de scoring) ;
Annoter les images pour réaliser du Machine Learning et permettre l'automatisation du système de monitoring.
Activité 3 : Contribuer à la mise en place d'un nouveau modèle, le médaka japonais :
Participer à la reproduction des animaux et aux essais de mise au point de challenges infectieux (viraux / bactériens).
Assurer la traçabilité du travail effectué (cahier de laboratoire) et contribuer à la mise à jour de la documentation qualité (procédures / modes opératoires / grilles de scoring .), la complétude des registres d'utilisation des animaux et des analyses rétrospectives ;
Interagir avec les partenaires intra-Anses et externes et participer à la présentation et valorisation des résultats obtenus.
Profil
Formation et expérience requises :
Bac à bac +3 - BTS Aquaculture ou équivalent
Niveau 2 en expérimentation animale avec expérience(s) de la réalisation / du suivi d'essai(s) sur poissons
Compétences :
Capacités à travailler sur animaux (poissons)
Compétences en zootechnie des poissons
Connaissances des règles de biosécurité
Forte affinité pour l'observation / le bricolage
Aptitudes relationnelles et goût pour le travail en équipe
Polyvalence et adaptabilité
Sens de l'organisation
Autonomie, rigueur et dynamisme
Capacités d'analyse
Maîtrise des outils informatiques (pack office)
Infos pratiques :
Poste basé sur le site Ifremer à Plouzané - Technopôle Brest-Iroise
Accès possible par transport en commun
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