Contexte
L’ADN environnemental (ADNe) s’est imposé ces dernières années comme un outil puissant pour retracer l’évolution spatiale et temporelle de la biodiversité. Cette empreinte génétique, laissée par les organismes dans leur environnement, est généralement rapidement dégradée par les microorganismes, ne fournissant qu’une vision instantanée des communautés présentes. Cependant, dans certains environnements terrestres riches en minéraux argileux, l’information génétique peut être préservée sur des durées allant jusqu’à plusieurs millions d’années grâce aux propriétés protectrices de la matrice minérale. La quantité d’ADNe ainsi stabilisée dans les environnements terrestres reste toutefois méconnue, en grande partie en raison de la difficulté à extraire l’ADN adsorbé tout en préservant son intégrité.
Objectifs du stage
L’objectif de ce stage est d’étudier les conditions qui favorisent les interactions entre l’ADN et les minéraux argileux dans des milieux modèles représentatifs de différents types de sols naturels (sols forestiers, sols arides, sols tropicaux, etc.).
Missions
Le·la stagiaire participera aux différentes étapes du projet, notamment :
• Purification et extraction des fractions granulométrique de minéraux argileux (kaolinite, illite, smectite)
• Saturation des minéraux avec différents cations environnementaux (K+, Mg2+, Ca2+, Al3+)
• Caractérisation des phases minérales.
• Etude des propriétés d’adsorption de l’ADN en fonction de la nature des minéraux argileux, de leur taille, de la nature des ions compensateurs, de la force ioniques, du pH et de la présence de matière organique.
Description de l'employeur
Recruté au CNRS, le ou la candidat(e) mènera ses recherches au sein de l’Institut de Chimie des Milieux et Matériaux de Poitiers (IC2MP), situé à l’Université de Poitiers (France). L’IC2MP est un laboratoire de recherche interdisciplinaire associant chimie et géosciences, co-porté par le CNRS et l’Université de Poitiers.
Le ou la candidat(e) intégrera l’équipe HydrASA, dont l’expertise est reconnue au niveau international dans la caractérisation, la compréhension et la modélisation de la réactivité des minéraux argileux. L’équipe développe notamment des approches expérimentales et théoriques originales permettant une intégration multi-échelle des phénomènes aux interfaces.
Les candidat(e)s intéressé(e)s sont invité(e)s à transmettre CV + lettre de motivation
Descriptif du profil recherché
• Étudiant·e en Master 2 en chimie ou géosciences
• Intérêt pour la recherche et les approches expérimentales
• Rigueur, autonomie et goût pour le travail en équipe
Conditions particulières d'exercice
Le ou la candidat(e) sera un(e) membre à part entière d’un consortium de recherche piloté par l’IC2MP, regroupant trois laboratoires couvrant les domaines de la microbiologie, biologie moléculaire, géosciences, physique et chimie. Ce projet implique une forte motivation à s’investir dans un environnement hautement interdisciplinaire et pluridisciplinaire.
Le ou la candidat(e) sera un(e) membre à part entière d’un consortium de recherche piloté par l’IC2MP, regroupant trois laboratoires couvrant les domaines de la microbiologie, biologie moléculaire, géosciences, physique et chimie. Ce projet implique une forte motivation à s’investir dans un environnement hautement interdisciplinaire et pluridisciplinaire.
Langues
Français ou anglais
Français ou anglais
Informations complémentaires
Ce stage s’inscrit dans un projet financé par l’ANR et pourra déboucher sur une proposition de thèse (financement déjà acquis) pour les candidats ou candidates intéressé(e)s par la poursuite en doctorat.
Ce stage s’inscrit dans un projet financé par l’ANR et pourra déboucher sur une proposition de thèse (financement déjà acquis) pour les candidats ou candidates intéressé(e)s par la poursuite en doctorat.
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