Chercheur·e postdoctoral en épidémiologie évolutive h/f

Dans le cadre d'un projet financé par l'ANR (VIRADAPT), nous voulons mieux comprendre comment les pathogènes s'adaptent aux vaccins et à l'immunité de l'hôte, afin de comprendre l'adaptation du SARS-CoV-2 au cours des premières années de la pandémie, développer de nouvelles méthodes de caractérisation des phénotypes des variants, et identifier des stratégies vaccinales plus durables.

Nous recherchons un.e chercheur.e postdoctoral.e pour développer des modèles mathématiques en épidémiologie évolutive. Les modèles décriront la population hôte hétérogène (naïve, naturellement immunisée ou vaccinée) et plusieurs variants du SARS-CoV-2 évoluant dans cette population. Le modèle sera informé par, et ajusté à, des données exceptionnelles sur l'infection et le statut immunitaire de millions d'individus au Royaume-Uni au cours des trois premières années de la pandémie. Les séquences génomiques du virus pourront également être analysées pour déduire la dynamique spatiale de plusieurs variants du virus au Royaume-Uni.
Activités
- Développer et analyser des modèles mathématiques
- Développer des modèles de simulation stochastique pour suivre les dynamiques épidémiologiques et évolutives
- Nettoyer et analyser les données épidémiologiques (renseignant sur les infections et l'immunité)
- Ajuster les modèles mathématiques à ces données
- Optionnel : Analyser les données génomiques (phylogéographie)
- Présenter les résultats lors de conférences scientifiques
- Rédiger des publications scientifiques pour communiquer les résultats
Compétences
- Expérience dans le développement et l'analyse de modèles épidémiologiques
- Expérience dans l'analyse de données / modélisation statistique
- Capacité à travailler en équipe et à communiquer les résultats (communications orales et publications)
Contexte de travail

Le/la postdoctorant.e sera basé.e au centre de Paris (Centre de Recherche Interdisciplinaire en Biologie, UMR CNRS 7241, Collège de France) dans une unité spécialisée dans les modèles mathématiques pour l'étude de l'évolution. Iel travaillera sur le projet avec des collègues de Montpellier (dont un.e autre chercheur.e postdoctoral.e embauché.e sur le même projet) et de l'Université d'Oxford. Le.la postdoctorant.e se rendra régulièrement à l'Université d'Oxford.
Contraintes et risques

Le projet de recherche ne nécessite aucune expérimentation, ni travail de terrain, ni manipulation, et consiste en un travail de modélisation hébergé au sein de l'unité CIRB du Collège de France. Il n'y a pas de problèmes de sécurité particuliers, hormis les risques, notamment musculo-squelettiques, inhérents au travail sur ordinateur.