Bioinformaticien (ne) de recherche niveau 4

This a Full Remote job, the offer is available from: Canada

Au CHU Sainte-Justine, on a le sens de la famille. Donne un sens à ta carrière!

Mission

Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront d’innombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes, soit plus de 295 chercheuses et chercheurs, dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines d’expertise multiples. Travaillant étroitement avec les équipes de soins du CHU Sainte-Justine, cette communauté se dévoue à la recherche fondamentale, clinique et translationnelle au sein de six axes de recherche.

Description De L’établissement

Le CHU Sainte-Justine (CHUSJ) est le plus important centre hospitalier mère-enfant au Canada. Avec plus de 1,400 employés, étudiants et chercheurs, les recherches de pointe qui sont conduites au Centre de recherche Azrieli du CHUSJ (CRA-CHUSJ) visent à comprendre les mécanismes qui sous-tendent la maladie et à développer de nouveaux outils diagnostiques, thérapeutiques et préventifs pour améliorer la qualité de vie et la qualité des soins dispensés aux mères et aux enfants. Pour plus d’information, visitez le site web du CR CHUSJ au http://recherche.chusj.org/fr/accueil.

Projet

Le CHUSJ et l’Hospital for Sick Children (SickKids) de Toronto ont récemment mis sur pied un partenariat de recherche qui vise à transformer les soins pédiatriques via le développement de nouveaux paradigmes en santé de précision. Ce partenariat sans précédent dans l’histoire canadienne s’appuiera sur la création de synergies centrées sur l’utilisation de technologies de pointe et le partage et l’exploitation de grands jeux de données. Le CHUSJ recherche un bioinformaticien pour soutenir le développement du volet de génomique translationnelle de ce partenariat.

Tes défis

Sous La Responsabilité Du Dr Jacques L Michaud Et Prof. Vincent Ferretti, Chercheurs Au CHUSJ, Le Bioinformaticien Aura La Responsabilité De

* Mettre en place des pipelines qui permettent d’identifier, annoter et analyser des variants génétiques et épigénétiques à partir de données de séquençage (génome complet et transcriptome). Les données à analyser proviendront du séquençage de courte lecture (systèmes NovaSeq 6000 et NovaSeq X Plus d’Illumina) et de longue lecture (systèmes Revio de PacBio et Promethion d’Oxford Nanopore);
* Réaliser différentes analyses bioinformatiques approfondies à partir des jeux de données générés par les séquenceurs de nouvelle génération;
* Évaluer et intégrer différents outils bioinformatiques disponibles pour améliorer les procédures d’analyses du laboratoire
* Organiser les réunions de l’équipe de projet et diriger les discussions sur les résultats de recherche obtenus
* Participer aux décisions opérationnelles et diriger la rédaction des articles et publication des projets;
* S’assurer de la bonne marche de l’étude, du suivi du protocole et de la qualité des données ;
* Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire, ainsi que la mise en place du système d’analyse;
* Organisation, hiérarchisation et archivage des données sur les serveurs;
* Documentation et communication sur le processus d’analyse, résultats, outils et techniques utilisés;
* Interaction avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyses.

Profil

Tes acquis

* Niveau d’études : Universitaire troisième cycle Doctorat en bioinformatique ou dans un domaine pertinent.
* Expérience en programmation avec les langages Bash et Python dans un environnement Linux;
* Connaissance et/ou expérience avec NextFlow, YAML ou WDL
* Expérience en processus d’analyse sur des grappes de calculs HPC ou infonuagiques.
* Expérience avec des banques de données SQL
* Proactif et capable de travailler de façon indépendante avec supervision minimale;
* Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
* Excellente gestion des priorités, rapidité d’exécution, sens de l’organisation et gestion du temps;
* Bonne compétence en gestion de données.

Notre offre (Conditions d’emploi)

* Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR)
* Échelle salariale: Niveau 4 - entre 32.91$/hr et 48.89$/hr
* Chercheur responsable: Dr Jacques Michaud
* Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
* Date prévue d’entrée en fonction : Immédiate

IMPORTANT

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : « Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l'enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé ».

Si ce poste vous intéresse, veuillez utiliser notre site de recrutement pour postuler en ligne.

Fin de l'affichage : 29 mai 2025

Autres avantages 3. Des établissements facilement accessibles4. Des services sur place pour vous simplifier la vie:Remarques

* Une conciliation travail et vie personnelle :
* Plan de vacances avantageux
* 20 jours de vacances par année, 25 jours de vacances dès la fin de la période de probation
* 13 jours fériés
* 9,6 jours de maladie par année
* Congé de maternité, de paternité et d’adoption
* Des avantages collectifs concurrentiels :
* Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)
* Assurances collectives pour vous et votre famille
* Programme d’aide aux employés et à leur famille
* Station de métro Université-de-Montréal, lignes d’autobus et grands axes routiers à proximité
* Abri à vélos sécurisé et stations BIXI à proximité
* Située dans le quartier Côte-des-Neiges
* Centre de la petite enfance Sainte-Justine
* Nettoyeur et service de couture
* Activités sportives
* Service alimentaire qui encourage l’agriculture biologique et locale
* Livraison de paniers de légumes biologiques

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d’alléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe d'accès à l'égalité en emploi et invite les femmes, les membres des minorités visibles et des minorités ethniques, les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.
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